Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  211  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68569093--68569422
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6.9
48
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6
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1.98
68569093--68569413
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96
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393
25
27
19
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1.98
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2.3
144
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4
447
25
27
18
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1.98
68572235--68572278
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2.3
18
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11
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0
20
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1.53
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3.6
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10
162
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19
27
22
1.98
68572912--68573225
49
6.6
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71
10
194
31
19
26
22
1.98
68572912--68573227
93
3.3
94
78
7
284
31
19
26
22
1.98
68591201--68591580
48
7.9
48
79
4
365
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28
20
28
1.98
68591201--68591581
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144
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500
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28
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68594309--68594350
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2.4
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273
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26
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40
5.6
40
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3
236
26
28
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24
1.99
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1.9
26
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1.70
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2.1
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31
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305
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1.97
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3.4
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9
188
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16
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25
1.97
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25
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1.98
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18
2.2
18
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0
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38
10
30
20
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68655259--68655340
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2.0
42
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0
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21
2.0
21
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55
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1
0
26
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0
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68688192--68688288
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68695051--68695108
22
2.6
22
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17
3
39
1.66
68695064--68695108
22
2.0
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35
17
4
42
1.70
68695087--68695189
18
5.7
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68695100--68695192
37
2.6
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3
134
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13
10
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1.80
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2
103
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27
14
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1.95
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1.9
261
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1
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32
1.96
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200
3.7
200
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1
1219
28
22
18
30
1.97
68695820--68696566
405
1.9
400
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2
1255
28
22
18
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1.97
68697510--68697567
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12
61
3
10
0
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12
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11.5
39
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2
447
29
26
21
21
1.99
68699663--68700054
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158
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27
21
21
1.99
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79
6.3
78
80
3
475
29
26
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68699570--68700073
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25
22
22
1.99
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152
29
29
19
21
1.98
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1.9
93
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30
19
21
1.98
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21
105
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28
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22
1.97
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19
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29
1.97
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11
17
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3.0
30
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11
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0
62
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0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68766029--68766054
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2.2
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15
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1.18
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0
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50
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0
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1.12
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0
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0
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1.12
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17
2.0
16
94
5
57
78
0
12
9
0.95
68792196--68792326
35
3.7
35
73
11
99
28
8
21
41
1.82
68798038--68798218
86
2.1
86
98
1
355
40
4
7
47
1.52
68798285--68798499
51
4.0
51
84
15
301
46
18
7
27
1.75
68798324--68798451
62
2.1
63
97
2
242
48
17
6
27
1.71
68798285--68798499
112
1.9
112
96
3
398
46
18
7
27
1.75
68798445--68798555
33
3.4
34
82
10
115
43
17
8
31
1.78
68801579--68802437
119
7.2
119
97
1
1596
43
2
5
47
1.39
68802146--68802180
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
68802166--68802321
30
5.2
30
62
21
76
44
3
3
47
1.39
68802386--68802420
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
68802585--68802675
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
68802656--68802724
16
4.2
16
90
3
111
36
36
1
26
1.66
68804551--68804630
35
2.3
35
77
12
92
25
10
22
42
1.84
68809440--68809519
35
2.3
35
77
12
92
25
10
22
42
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68815128--68815251
20
6.1
21
73
14
75
36
1
3
58
1.24
68815111--68815226
60
2.0
58
86
3
160
42
0
2
55
1.13
68817411--68817632
49
4.6
48
78
6
207
24
22
17
36
1.95
68817374--68817629
97
2.6
97
79
10
247
23
22
16
37
1.94
68817415--68817632
97
2.2
97
81
12
252
24
22
16
35
1.95
68820165--68820202
18
2.1
18
90
0
58
0
26
0
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0.83
68823273--68823345
30
2.3
32
81
4
78
45
5
2
46
1.40
68828281--68828322
20
2.1
20
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0
9
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1.31
68829204--68829242
6
6.5
6
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0
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33
0
30
1.58
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1.9
18
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2
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22
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1.39
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11
3.3
11
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2
8
0
0.58
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2
28.0
2
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0
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0
50
0
1.00
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27
2.2
27
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6
73
45
0
3
50
1.18
68850726--68850830
40
2.6
40
77
7
104
28
15
26
29
1.96
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26
2.0
27
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24
15
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1.92
68856697--68856778
26
3.2
26
94
0
146
36
25
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29
1.86
68863213--68863265
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
68864753--68864808
26
2.2
26
96
0
103
37
26
5
30
1.79
68873921--68873954
14
2.4
14
100
0
68
35
0
17
47
1.48
68875074--68875207
43
3.1
43
76
11
123
26
13
27
32
1.94
68878013--68878079
30
2.2
30
86
0
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23
31
22
22
1.98
68895750--68895983
45
5.2
45
88
4
323
23
21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68896764--68896820
28
2.0
28
100
0
114
22
31
28
17
1.97
68902208--68902385
40
4.5
40
90
3
245
22
25
28
23
1.99
68914706--68914887
40
4.6
40
88
0
258
23
22
28
25
1.99
68926152--68926205
27
2.0
27
85
0
72
40
7
14
37
1.74
68926454--68926585
51
2.6
50
90
3
194
25
18
26
30
1.98
68926451--68926637
50
3.7
51
80
7
204
26
16
26
30
1.97
68928366--68928400
14
2.5
14
90
0
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45
2
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22
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30
0
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1.58
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1.9
44
85
7
118
26
25
20
28
1.99
68950349--68950442
44
2.2
43
82
5
109
26
26
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325