Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  2  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
437183--437736
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437535--437901
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1.9
191
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0
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0
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0
0
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205
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405
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29
17
22
29
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2.1
12
100
0
50
40
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16
2.8
15
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30
6
0
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2.6
13
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9
50
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2.8
22
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135
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14
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252
2.8
257
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3
1055
15
9
53
21
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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69
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1.70
470731--471071
66
5.1
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12
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14
9
52
22
1.71
470722--471190
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3.5
135
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2.0
117
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53
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117
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401
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18
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18
1.9
18
88
0
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17
14
54
14
1.72
470358--471104
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387
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30
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30
2.2
30
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1.74
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25
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0
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145
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0
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2
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22
2.0
22
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2.1
31
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143
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2.8
92
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293
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1.83
493733--494006
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3.0
91
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4
302
43
11
17
27
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
502550--502597
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2.2
21
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18
2
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0
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2.3
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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0
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30
1.92
577801--577826
3
8.7
3
100
0
52
30
0
34
34
1.58
579473--579502
14
2.1
14
93
6
51
20
10
0
70
1.16
583450--583521
37
1.9
37
83
10
94
58
6
5
29
1.47
585076--585303
88
2.6
86
83
7
273
35
19
16
28
1.93
585223--585431
74
2.9
71
82
7
256
32
22
18
27
1.97
585223--585432
73
2.9
72
81
9
271
31
21
18
28
1.97
585160--585762
241
2.5
237
83
6
729
33
20
17
28
1.95
585451--585664
76
2.8
78
86
4
321
31
23
17
27
1.97
585458--585690
76
3.1
73
82
5
286
32
22
16
29
1.95
585676--585706
16
1.9
16
93
0
53
64
6
12
16
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
585601--585775
89
2.0
90
90
1
280
38
21
16
24
1.93
600274--600336
31
2.0
31
87
6
92
50
4
6
38
1.49
600505--600601
43
2.3
43
83
7
117
56
5
5
32
1.43
600526--600613
14
6.7
13
71
20
51
59
3
3
34
1.31
600746--600786
21
2.0
21
85
0
55
46
2
7
43
1.44
601023--601084
3
20.3
3
86
3
88
61
6
0
32
1.21
601551--601608
22
2.6
22
81
10
73
15
6
51
25
1.68
602128--602160
15
2.2
15
94
0
57
69
3
6
21
1.24
602082--602500
89
4.7
89
81
7
469
36
19
16
27
1.93
602392--602425
13
2.5
14
85
9
52
64
2
11
20
1.39
602409--602644
72
3.2
73
81
6
278
32
20
19
27
1.97
602489--603234
164
4.5
164
89
3
1079
31
21
18
28
1.96
602648--602793
75
1.9
75
92
0
247
27
23
17
30
1.97
602497--603222
336
2.2
327
86
5
1064
31
21
18
28
1.97
602895--603069
89
2.0
89
89
2
271
32
20
18
28
1.96
602982--603148
75
2.2
75
89
3
264
34
20
16
28
1.95
603128--603162
14
2.5
14
100
0
70
57
5
20
17
1.60
603058--603319
89
2.9
90
86
2
386
36
19
16
27
1.93
606171--606228
22
2.6
22
86
0
80
13
6
53
25
1.65
608070--608124
27
2.0
27
92
0
92
40
5
9
45
1.59
611717--611749
13
2.4
14
90
10
50
45
0
0
54
0.99
613135--613162
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
620741--621065
131
2.5
131
90
2
494
27
17
19
36
1.94
628118--628419
131
2.3
130
82
7
314
25
18
19
37
1.94
630649--630691
20
2.0
22
86
8
63
58
0
2
39
1.11
639234--639284
24
2.1
24
88
0
75
37
3
9
49
1.55
639434--639466
5
6.6
5
86
13
50
15
3
0
81
0.80
640957--640990
6
5.7
6
96
0
50
79
0
5
14
0.91
642384--642529
25
5.7
24
69
13
78
46
7
0
45
1.31
642377--642527
76
2.0
76
94
0
266
44
7
0
48
1.30
644829--644884
3
18.7
3
96
0
85
60
0
5
33
1.19
645894--645961
15
4.5
15
98
0
127
7
0
47
45
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325