Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  243  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79431500--79431559
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1.99
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3.9
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222
26
22
28
23
1.99
79444593--79444738
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1.9
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26
22
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23
2.00
79444593--79444770
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2.3
78
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2.6
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4.8
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172
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11
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.97
79558152--79558371
46
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2
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2
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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1.8
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91
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21
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3.0
30
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10
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12
25
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79689733--79689994
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25
2.1
25
85
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70
36
25
7
30
1.84
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40
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26
27
21
24
1.99
79714673--79714896
83
2.8
80
85
5
265
26
27
21
24
1.99
79715008--79715138
65
2.0
65
96
0
244
32
19
16
32
1.93
79722968--79723191
40
5.6
40
85
6
292
25
27
23
24
2.00
79722968--79723191
83
2.8
80
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299
25
27
23
24
2.00
79723303--79723433
65
2.0
65
96
0
244
32
19
16
32
1.93
79725682--79725843
80
2.0
80
91
2
263
35
9
16
38
1.81
79727051--79727130
28
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29
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3
16
1.64
79727277--79727309
17
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17
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40
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3
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3
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19
11
18
1.76
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341
2.9
340
89
1
1469
43
16
11
28
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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32
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1.88
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13
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13
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0
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30
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38
1.9
38
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0
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1.99
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1.99
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1.99
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1.99
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51
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1.64
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1.99
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25
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21
25
1.99
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25
1.99
79810600--79810823
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78
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4
252
25
27
21
25
1.99
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1.9
30
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2.0
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0
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1
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0
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1.11
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21.4
7
70
19
90
31
1
0
66
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79814643--79814787
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12
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1
0
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17.8
5
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31
2
0
66
1.03
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18
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0
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1
0
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31
1
0
66
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325