Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  4  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
998618--998652
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2.0
17
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0
0
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999009--999078
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4.2
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1
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1
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1.64
999009--999078
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2.1
33
92
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115
35
38
1
24
1.64
1003005--1003033
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2.0
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0
0
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2.2
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24
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38
1.82
1013176--1013443
104
2.6
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1
450
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30
20
18
1.97
1013771--1013834
30
2.2
29
81
10
76
29
28
6
35
1.82
1013778--1013834
30
1.9
30
85
3
80
29
24
7
38
1.82
1018133--1018170
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2.4
24
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3
60
62
0
1
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1.9
24
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0
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0
0
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1.9
17
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0
0
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17
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51
15
0
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1
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8
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41
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1
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18
4.2
18
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6
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30
22
14
32
1.94
1062629--1062811
43
4.3
43
87
1
251
25
17
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1062629--1062811
85
2.1
86
88
1
269
25
17
28
28
1.98
1066675--1066734
30
2.0
30
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0
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28
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1067111--1067416
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1.9
157
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1.88
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27
2.0
27
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0
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1.91
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2.3
24
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11
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1.67
1081331--1081372
5
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0
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0
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204
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27
19
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1.98
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1.8
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3
272
29
27
20
22
1.99
1086356--1086415
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2.0
30
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1.85
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3.0
37
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1096313--1096343
16
1.9
16
100
0
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32
25
22
19
1.97
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42
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20
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4
100
0
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22
0
0
0.76
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2.5
19
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13
51
59
0
0
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2.0
43
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2
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20
34
1.85
1114457--1114512
11
5.2
11
78
4
60
64
1
0
33
1.04
1114457--1114540
43
2.0
41
81
4
96
59
2
0
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1.10
1117725--1117834
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4.2
26
95
0
175
32
5
25
36
1.79
1119420--1119559
27
5.2
27
87
5
176
18
24
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
19
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0
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18
0
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2.3
27
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13
83
30
11
9
49
1.70
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4
11.8
4
100
0
94
48
25
0
25
1.51
1128929--1128968
4
10.0
4
94
0
71
47
25
2
25
1.64
1128729--1129087
159
2.2
160
87
4
490
35
27
4
31
1.78
1129304--1129332
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2.1
14
93
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51
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31
0
0
0.89
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2.4
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19
15
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1.93
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2.9
29
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14
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6
3
57
1.42
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21
2.4
21
100
0
100
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20
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1.9
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21
14
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1.93
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3.5
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0
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0
0
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0
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0
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20
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4
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18
4
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0
1
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1.04
1176478--1176541
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0
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0
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19
15
17
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1.82
1184168--1184247
27
3.0
27
79
0
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25
28
25
21
1.99
1184283--1184340
27
2.1
27
87
6
82
67
1
0
31
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1185096--1185127
16
2.0
16
93
0
55
40
18
9
31
1.83
1185462--1185519
19
3.2
18
80
9
64
62
1
0
36
1.06
1195115--1195411
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4.4
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88
0
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22
24
25
2.00
1195537--1195959
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5
315
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18
16
32
1.94
1195602--1195961
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79
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7
475
30
19
17
32
1.95
1206072--1206141
31
2.2
32
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2
79
61
2
4
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1.30
1206280--1206367
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4.8
17
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63
0
10
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1206281--1206327
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17
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0
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1.9
41
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62
0
11
25
1.29
1206354--1206447
41
2.3
41
83
9
111
62
4
5
27
1.35
1206403--1206441
20
2.0
20
89
0
60
66
2
5
25
1.25
1206628--1206705
28
2.8
27
84
7
93
64
2
8
24
1.36
1208941--1208983
20
2.0
23
86
13
65
62
0
0
37
0.95
1211721--1211825
46
2.3
46
94
0
183
42
8
27
20
1.81
1211967--1212002
11
3.3
11
88
11
56
27
5
47
19
1.72
1215201--1215225
12
2.1
12
100
0
50
16
8
0
76
1.02
1215233--1215291
13
4.9
12
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19
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28
1
0
69
0.98
1215213--1215262
20
2.8
17
77
16
55
24
6
2
68
1.23
1215235--1215295
26
2.3
27
83
11
81
27
1
0
70
0.97
1215233--1215285
22
2.4
22
87
6
72
28
1
0
69
0.99
1215254--1215294
13
3.2
13
100
0
82
29
0
0
70
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1220647--1220831
86
2.2
86
84
0
244
32
27
15
24
1.95
1220647--1220835
43
4.4
43
82
0
216
33
27
15
23
1.95
1223237--1223284
22
2.1
23
84
3
62
52
29
4
14
1.60
1225075--1225099
12
2.1
12
100
0
50
16
8
0
76
1.02
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19
2.9
19
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15
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42
46
3
7
1.49
1228153--1228194
14
3.1
14
79
3
50
30
2
7
59
1.37
1236249--1236322
21
3.7
19
73
7
58
27
35
25
12
1.91
1236249--1236291
21
2.0
21
90
0
68
34
37
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9
1.83
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30
2.1
30
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0
106
27
1
11
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1.41
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21
3.2
21
69
13
62
43
15
20
20
1.87
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6
8.5
6
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0
75
35
0
21
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1.53
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18
2.9
18
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0
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35
1
20
41
1.64
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3
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3
100
0
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0
0
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3
14.3
3
95
0
77
30
0
2
67
1.03
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23
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22
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38
1
0
60
1.07
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22
1.9
22
85
9
59
40
0
7
52
1.29
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26
2.0
26
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0
97
30
15
5
49
1.67
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4
10.2
4
100
0
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24
0
26
48
1.51
1285262--1285318
26
2.2
26
81
6
62
33
3
12
50
1.57
1285290--1285357
32
2.1
33
86
2
93
26
1
19
52
1.54
1293762--1293854
30
3.2
30
64
27
83
41
9
21
26
1.84
1293759--1293873
56
2.1
56
100
0
230
41
9
19
29
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1296388--1296418
6
5.2
6
92
0
53
12
35
0
51
1.40
1297327--1297352
12
2.2
12
100
0
52
23
15
30
30
1.95
1298076--1298138
24
2.6
24
92
0
99
23
6
6
63
1.41
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87
2.0
87
100
0
352
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14
13
35
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16
2.1
16
100
0
68
29
11
11
47
1.76
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46
8.8
46
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1
535
21
22
13
41
1.88
1311237--1311634
139
2.9
137
87
2
546
21
22
14
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1.88
1311275--1311642
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2.0
185
93
0
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22
23
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0
50
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0
0
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18
2.0
18
100
0
72
33
22
22
22
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325