Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  191  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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62084404--62084627
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20
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2.0
27
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26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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62146888--62147234
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1.97
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28
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1.97
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2.0
40
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8
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29
1.87
62183999--62184362
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29
1.87
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2.1
36
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2
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17
32
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
1.99
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1.99
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4.7
47
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33
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1.87
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1.9
119
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1.87
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2.1
37
90
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122
24
18
31
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62215301--62215325
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20
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0
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0
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0
128
13
25
32
28
1.93
62265254--62265482
40
5.7
40
91
4
381
25
22
27
24
2.00
62265258--62265515
120
2.2
120
90
3
405
25
22
27
24
2.00
62272804--62273209
47
8.6
47
92
1
609
29
29
8
33
1.87
62272804--62273200
96
4.2
96
90
3
622
28
29
8
32
1.87
62277608--62277835
40
5.7
40
88
4
336
27
22
25
24
2.00
62277608--62277868
80
3.3
80
88
3
377
27
22
25
23
2.00
62280410--62280465
21
2.7
21
94
0
103
21
28
37
12
1.90
62281642--62281910
48
5.7
46
71
13
181
25
29
18
26
1.98
62290558--62290596
21
1.9
20
84
5
51
61
5
17
15
1.51
62292918--62292954
18
2.1
18
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0
56
18
24
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43
1.86
62293088--62293134
18
2.6
18
93
6
78
17
44
4
34
1.68
62294499--62294704
98
2.1
98
79
0
214
29
15
15
39
1.88
62294388--62295018
224
2.8
223
83
3
737
29
15
15
39
1.88
62294849--62295269
126
3.4
125
81
6
435
31
14
13
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62295385--62295463
33
2.6
28
74
24
72
43
10
1
45
1.45
62295476--62295521
22
2.1
22
83
0
56
45
28
4
21
1.71
62299253--62299300
16
3.1
16
82
11
64
60
8
2
29
1.37
62299253--62299293
14
2.7
15
85
11
57
58
9
0
31
1.31
62300930--62300959
15
2.0
15
93
0
51
16
6
3
73
1.18
62310297--62310543
47
5.2
46
73
11
162
26
19
29
24
1.99
62310326--62310452
44
2.8
47
77
10
147
22
19
29
27
1.98
62310419--62310546
49
2.6
50
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6
165
28
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28
21
1.98
62324832--62324940
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2.1
53
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0
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19
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19
4.7
19
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5
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36
14
11
36
1.83
62330905--62330991
36
2.3
37
92
7
149
36
14
11
36
1.83
62330905--62331001
36
2.6
35
77
20
108
37
14
11
37
1.82
62331381--62331892
206
2.5
206
91
0
819
28
22
17
31
1.96
62331788--62331998
106
2.0
106
95
0
377
29
21
15
33
1.94
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312
2.0
311
91
0
1012
29
21
17
32
1.96
62332198--62332361
44
3.7
43
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152
26
24
18
30
1.98
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26
2.1
26
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6
65
7
16
0
75
1.01
62333215--62333253
18
2.2
18
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0
60
5
10
0
84
0.76
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11
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10
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12
71
1
12
0
85
0.66
62333209--62333279
16
4.3
17
74
10
58
4
11
0
84
0.75
62333209--62333266
26
2.2
26
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9
82
5
10
0
84
0.77
62338106--62338171
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62338123--62338220
19
5.2
19
90
7
155
36
16
10
36
1.82
62338123--62338220
36
2.6
37
88
9
144
36
16
10
36
1.82
62338809--62338864
11
4.9
11
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16
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60
0
0
39
0.97
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18
2.4
19
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11
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22
2
2
72
1.07
62341148--62341183
13
2.8
14
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27
25
0
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1.52
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2.2
19
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2.5
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2
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0
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23
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0
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16
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1.23
62342778--62342802
13
1.9
13
100
0
50
0
12
8
80
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325