Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  300  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.52
Indices
Period
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(0-2)
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28
1.44
97863403--97864142
45
15.8
45
68
12
321
27
24
18
29
1.98
97863403--97863815
185
2.2
185
89
2
639
26
24
18
30
1.98
97863883--97864087
44
4.4
44
68
12
149
24
23
22
28
1.99
97863639--97864089
143
3.2
143
89
1
665
26
23
19
29
1.99
97866134--97866163
15
2.0
15
100
0
60
40
6
0
53
1.27
97866778--97866816
21
1.9
20
84
5
51
53
17
0
28
1.44
97867488--97867513
7
3.7
7
100
0
52
88
0
0
11
0.52
97868417--97868472
22
2.6
22
83
5
62
51
0
0
48
1.00
97870403--97870462
27
2.2
28
93
3
104
50
8
13
28
1.70
97870826--97871053
24
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24
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11
95
32
19
25
22
1.97
97870828--97870968
48
2.9
49
76
6
142
31
21
25
21
1.98
97870890--97871053
24
6.6
25
72
14
108
32
18
25
23
1.97
97871094--97871150
24
2.3
25
79
8
64
36
22
24
15
1.94
97871673--97871713
20
2.1
20
86
4
57
34
7
2
56
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97872798--97872825
14
2.0
14
100
0
56
78
7
0
14
0.95
97872955--97872979
13
1.9
13
100
0
50
48
0
36
16
1.46
97872917--97873117
76
2.7
75
81
10
214
36
2
38
21
1.67
97879479--97879567
9
9.9
9
82
11
78
26
2
2
68
1.13
97879479--97879567
15
6.0
14
76
15
74
26
2
2
68
1.13
97881119--97881153
17
2.1
17
100
0
70
54
11
22
11
1.68
97884240--97884283
20
2.2
20
100
0
88
11
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18
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1.82
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14
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16
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16
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31
7
2
57
1.41
97886971--97887001
12
2.6
12
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0
53
6
22
29
41
1.78
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2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
97891933--97892049
47
2.5
47
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2
155
17
19
21
41
1.90
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18
3.7
18
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36
8
11
42
1.73
97892175--97892262
36
2.4
37
79
5
108
37
11
11
39
1.77
97894194--97894321
27
4.7
27
89
0
193
28
21
9
40
1.84
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27
10.7
27
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5
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35
21
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34
1.84
97894425--97894669
27
9.1
27
84
1
285
36
17
20
25
1.94
97894876--97894970
25
3.8
25
91
0
145
26
24
22
27
2.00
97894876--97894983
25
4.4
25
85
8
100
28
22
22
26
1.99
97894888--97894995
50
2.2
51
80
8
123
26
25
21
25
1.99
97899490--97899546
5
11.2
5
92
7
89
42
0
0
57
0.98
97899825--97899872
15
3.2
16
77
14
57
75
2
16
6
1.11
97901275--97901323
20
2.4
21
76
10
66
61
0
6
32
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97901449--97901473
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
97901504--97901620
47
2.5
47
88
2
164
16
19
22
41
1.90
97901748--97901833
18
4.7
18
79
1
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36
10
12
40
1.78
97901745--97901833
36
2.4
37
81
5
110
35
11
13
39
1.80
97902775--97903854
178
6.1
178
87
2
1463
29
18
26
25
1.98
97902777--97903822
44
23.5
45
64
11
201
28
18
26
25
1.98
97908076--97908250
58
3.1
57
87
7
218
26
23
15
34
1.95
97908086--97908250
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3.1
51
81
11
204
26
23
16
33
1.95
97915832--97915925
40
2.3
40
94
0
161
21
21
26
30
1.98
97915832--97915940
40
2.7
40
88
2
148
22
20
25
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325