Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  299  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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1.91
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28
20
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
97624065--97624316
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21
1.96
97629416--97629871
87
5.2
87
92
0
741
33
20
24
21
1.97
97629257--97629654
218
1.8
218
93
0
688
34
19
24
21
1.96
97629634--97630089
217
2.1
217
92
0
761
34
20
23
21
1.96
97629331--97629958
261
2.4
261
77
5
807
34
19
24
21
1.97
97629851--97630143
87
3.4
87
94
0
514
34
20
23
20
1.97
97631936--97631980
23
2.0
23
82
8
56
26
2
4
66
1.22
97631759--97632087
3
109.0
3
67
16
137
27
8
3
60
1.40
97632143--97632190
19
2.9
16
80
17
53
16
8
4
70
1.27
97634922--97635072
53
2.8
53
88
4
205
29
27
16
26
1.97
97640840--97640865
3
8.7
3
100
0
52
0
30
0
69
0.89
97642252--97642629
3
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3
66
13
127
61
3
7
28
1.39
97642564--97642601
20
1.9
20
100
0
76
63
0
5
31
1.17
97648680--97649018
135
2.5
135
86
0
455
30
21
20
27
1.98
97649136--97649254
44
2.7
44
85
3
150
31
21
23
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97648815--97649257
180
2.5
180
84
0
600
31
20
21
26
1.98
97650574--97650615
14
2.9
15
89
7
68
28
7
2
61
1.35
97650668--97650739
16
4.5
16
67
17
51
37
1
0
61
1.05
97652511--97652570
30
2.0
30
90
0
93
25
3
11
60
1.47
97653227--97653259
17
2.0
17
88
5
50
27
0
6
66
1.15
97663533--97663577
23
2.0
22
83
12
56
40
2
0
57
1.11
97665569--97665679
43
2.6
43
83
8
136
41
21
15
21
1.90
97665660--97665742
42
2.0
42
87
0
121
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18
14
21
1.84
97670058--97670101
14
3.1
14
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3
52
45
36
0
18
1.49
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2.4
46
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4
161
45
25
1
27
1.63
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7
5.7
7
87
0
53
52
27
0
20
1.46
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4.1
40
79
7
142
19
18
21
40
1.91
97679864--97679899
17
2.1
17
90
10
56
38
5
0
55
1.23
97691672--97691715
19
2.4
18
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14
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77
2
4
15
1.04
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7.5
44
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6
213
20
23
20
35
1.96
97692485--97692844
88
4.1
88
89
2
553
20
23
20
35
1.96
97692488--97692846
175
2.0
176
91
1
587
20
23
20
35
1.96
97692828--97692910
44
1.9
43
85
2
112
24
24
21
30
1.99
97692842--97692933
43
2.1
44
83
2
114
22
26
22
28
1.99
97698440--97698565
63
2.0
63
98
0
243
29
23
25
22
1.99
97708638--97708670
16
2.0
16
94
5
57
24
6
3
66
1.28
97710526--97710670
58
2.4
60
80
7
161
36
2
14
46
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97712896--97712956
29
2.1
29
93
0
104
40
21
8
29
1.82
97713261--97713318
22
2.5
22
80
5
62
62
6
3
27
1.37
97713397--97713438
21
2.0
21
81
9
50
61
4
4
28
1.36
97713495--97713546
15
3.7
13
76
16
50
71
5
0
23
1.07
97713495--97713555
29
2.1
30
81
9
72
68
4
0
26
1.09
97713841--97713894
25
2.2
23
78
12
54
62
9
1
25
1.35
97715345--97715392
10
4.8
10
81
0
60
50
0
0
50
1.00
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17
1.9
18
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52
52
0
2
44
1.16
97716060--97716104
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12
85
5
63
42
0
2
55
1.12
97716062--97716102
13
3.2
13
77
19
50
39
0
2
58
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325