Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  315  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101443141--101443179
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17
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0
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2.0
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2.2
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50
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2.1
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2.0
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2.1
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4
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1.16
101474600--101474658
29
2.0
29
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75
0
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5
69
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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7
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10
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50
0
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1.31
101475707--101475811
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2.0
53
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3
158
48
0
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43
1.31
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3.0
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101481158--101481333
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28
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0
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0
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32
1.20
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3.2
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2.0
22
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56
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6
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60
0
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34
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0
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1
0
33
1.02
101512595--101512799
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2.3
89
80
10
211
59
0
5
34
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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34
1.21
101512773--101512831
21
3.0
20
82
7
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66
1
0
32
1.02
101512726--101512827
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4.1
25
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17
104
62
0
3
32
1.20
101520713--101520768
22
2.6
21
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8
44
1.63
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2.7
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5
11
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1.43
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0
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0
117
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6
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101553554--101553591
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1.02
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29
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1
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1.21
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0
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0
0
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101556186--101556243
22
2.7
22
84
5
66
51
0
0
48
1.00
101570981--101571061
41
2.0
42
95
2
146
35
8
28
27
1.86
101588175--101588233
19
3.2
19
65
18
52
54
5
3
37
1.39
101601676--101601709
17
2.0
17
100
0
68
35
29
17
17
1.93
101604287--101604351
32
2.0
32
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0
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53
7
16
21
1.68
101610056--101610093
19
2.0
19
100
0
76
31
31
15
21
1.94
101613905--101613951
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
101616821--101616864
21
2.1
21
100
0
88
20
22
18
38
1.93
101619775--101620365
302
2.0
287
90
9
928
39
5
5
49
1.50
101622522--101622721
108
1.9
108
90
0
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11
13
36
1.79
101626503--101626627
58
2.1
61
84
10
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4
35
1.45
101633863--101633976
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1.9
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50
1.66
101652171--101652250
26
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26
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0
133
37
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31
1.81
101655196--101655287
47
2.0
47
89
2
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45
4
16
33
1.67
101655625--101655661
19
1.9
20
88
5
58
72
2
0
24
0.97
101655689--101655828
10
14.3
10
69
14
53
60
5
1
32
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101655770--101655824
21
2.5
22
85
5
76
56
7
0
36
1.27
101656302--101656534
28
8.3
26
68
17
87
34
3
1
60
1.25
101656303--101656534
10
24.9
9
70
14
107
34
3
1
59
1.26
101656388--101656571
19
9.9
18
71
13
97
32
2
2
63
1.19
101656400--101656469
37
1.9
36
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8
88
32
1
1
64
1.11
101656388--101656543
18
8.6
17
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20
77
33
1
1
62
1.17
101656448--101656548
27
3.8
28
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33
1
1
62
1.18
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2.0
24
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6
6
40
1.53
101663835--101663929
30
3.2
30
77
5
84
44
3
22
30
1.68
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24
1.9
24
95
0
83
26
0
2
71
0.97
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4
7.0
4
100
0
56
50
0
25
25
1.50
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2.8
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10
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14
7
14
64
1.48
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30
3.8
30
78
4
117
45
3
22
28
1.69
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3
13.0
3
88
0
60
69
2
0
28
1.02
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24
2.0
25
84
4
64
55
6
4
34
1.44
101672784--101672829
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4.2
11
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0
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84
0
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58
0
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1.20
101677858--101677996
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3.6
39
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201
14
26
22
36
1.92
101682883--101682911
13
2.1
14
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51
20
13
0
65
1.26
101685202--101685285
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2.0
42
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2
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22
20
17
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1.92
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5
5.0
5
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0
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0
0
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0.72
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7
5.6
7
84
3
51
55
2
2
39
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101687501--101687547
14
3.4
14
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2
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53
6
2
38
1.39
101690514--101690819
46
6.6
46
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366
41
12
23
22
1.87
101693940--101694102
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4.5
35
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20
20
33
1.97
101693982--101694189
74
2.8
75
86
2
276
27
20
19
31
1.97
101693937--101694176
35
6.6
35
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135
26
20
20
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0
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13
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20
1.98
101703037--101703109
28
2.6
28
78
10
85
46
1
4
47
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325