Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  249  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81263757--81263806
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2.0
25
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0
100
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1.92
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2.3
30
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20
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1.69
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4.8
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179
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20
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135
2.1
135
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4
375
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24
19
26
1.99
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123
2.6
124
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429
35
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1.94
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4
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30
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30
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2
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0
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2.6
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25
0
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65
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16
28
28
1.97
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2.9
52
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175
27
16
27
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.97
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27
6.8
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101
26
16
28
29
1.97
81312704--81312888
82
2.3
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210
26
16
28
29
1.97
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1.9
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215
26
16
28
28
1.97
81320819--81320972
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
81320820--81320975
27
5.7
27
81
6
163
26
16
28
28
1.97
81320812--81320996
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
81320812--81320996
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78
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210
26
16
28
29
1.97
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2.1
56
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23
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8
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1.87
81325958--81326602
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935
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20
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1.8
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16
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433
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17
28
1.97
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2.2
177
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439
26
26
17
29
1.97
81335911--81336007
44
2.2
45
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10
119
30
27
16
24
1.96
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310
2.1
309
84
4
859
26
27
17
28
1.98
81335757--81336278
178
2.9
178
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701
27
27
17
28
1.97
81335979--81336251
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89
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239
25
27
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1.98
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6
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20
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0
60
30
10
5
53
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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148
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32
15
18
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1.92
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275
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16
20
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1.94
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1.71
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26
45
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1.71
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3.5
22
73
14
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37
3
2
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13
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3
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1.10
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3.6
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2.1
19
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10
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13
37
29
18
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81390206--81390262
24
2.4
24
77
11
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19
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3.0
148
95
0
778
31
16
26
25
1.96
81402629--81402655
11
2.5
11
100
0
54
92
7
0
0
0.38
81408306--81408602
47
6.3
47
92
2
452
28
29
8
32
1.87
81408306--81408731
49
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49
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11
480
29
29
8
33
1.86
81408589--81408616
14
2.0
14
100
0
56
28
28
7
35
1.84
81408540--81408665
63
2.0
63
100
0
252
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28
7
33
1.86
81408491--81408714
112
2.0
112
98
0
430
29
28
8
33
1.86
81412155--81412474
40
8.1
39
87
5
419
26
28
20
24
1.99
81412168--81412467
159
1.9
159
89
2
469
26
28
21
24
1.99
81412528--81412602
38
2.0
38
86
5
107
24
26
18
30
1.98
81414930--81415012
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3.3
27
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27
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34
1.78
81414737--81415148
49
8.6
49
89
7
575
29
29
8
33
1.86
81414737--81415148
95
4.3
94
87
8
564
29
29
8
33
1.86
81414737--81415148
144
2.9
143
88
7
620
29
29
8
33
1.86
81427805--81427981
92
1.9
93
92
1
302
20
10
11
57
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
2.0
19
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0
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47
15
10
26
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28
2.0
28
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74
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5
13
22
1.56
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40
3.6
40
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4
175
24
25
24
26
2.00
81436657--81436806
43
3.5
43
71
12
112
26
18
26
28
1.98
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10
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25
0
32
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1.56
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2.1
22
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0
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0
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0
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13
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1.05
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29
18
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21
1.97
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2.1
46
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0
181
28
6
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32
1.82
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1.8
117
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1.83
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3.0
51
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0
232
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1.91
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2.5
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1.82
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3.7
47
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1
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30
27
1.88
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2.1
37
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0
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1.97
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48
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28
30
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1.97
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13
4.1
13
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28
7
25
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1.83
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15
4.6
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1.61
81492678--81492863
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97
1
356
38
11
19
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1.87
81509902--81509953
27
2.0
26
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68
17
26
21
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1.95
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1.95
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15
2.6
15
85
14
55
60
12
0
27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81520942--81521287
84
4.1
85
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304
29
19
17
34
1.94
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17
2.2
18
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23
30
20
1.98
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1.8
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0
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29
21
20
1.98
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28
29
21
20
1.98
81545556--81545727
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1.8
93
94
0
308
27
29
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21
1.99
81545549--81545724
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46
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189
28
29
21
21
1.98
81545557--81545743
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4.0
46
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27
29
20
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1.98
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24
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0
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1.68
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40
2.9
41
78
10
127
25
16
28
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325