Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  208  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67235178--67235253
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27
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2
2
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1.26
67235180--67235235
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2.5
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2.0
30
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4.8
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244
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20
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3.0
30
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28
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2.1
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2
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32
30
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
41
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4.7
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1.98
67367458--67367503
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2.0
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50
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67376713--67376755
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20
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0
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57
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18
1.01
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1.42
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3.0
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58
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2.4
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0
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55
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33
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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1.96
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1.96
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1.95
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1.9
17
100
0
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42
6
6
45
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67519580--67519667
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11
32
1.87
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23
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21
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17
17
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303
27
16
26
30
1.96
67542435--67542761
100
3.3
100
85
1
404
26
15
26
30
1.96
67542435--67542761
50
6.5
50
81
2
350
26
15
26
30
1.96
67543087--67543137
25
2.0
25
100
0
102
33
3
19
43
1.70
67543911--67543944
17
2.0
17
100
0
68
35
17
17
29
1.93
67544256--67544471
94
2.3
95
83
1
274
26
18
31
23
1.98
67544308--67544523
47
4.7
47
74
12
178
25
18
30
25
1.98
67547960--67548130
45
3.7
46
80
14
210
28
28
21
21
1.98
67547965--67548133
92
1.8
92
94
2
304
27
29
21
21
1.98
67548551--67548610
30
2.0
30
86
0
84
30
25
6
38
1.81
67552747--67552802
22
2.4
23
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8
87
50
21
14
14
1.78
67555558--67555732
45
3.8
49
78
15
183
28
28
21
21
1.99
67555563--67555732
93
1.8
92
96
1
313
28
29
21
21
1.98
67556150--67556209
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
67561323--67561491
47
3.6
47
76
12
152
26
20
31
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67578118--67578302
40
4.6
40
95
1
318
26
28
22
22
1.99
67584437--67584875
50
8.7
50
78
3
398
26
17
26
29
1.98
67584481--67584875
101
3.9
99
78
3
378
26
18
26
28
1.98
67584437--67584873
151
2.9
151
88
1
615
26
18
26
29
1.98
67592972--67593069
43
2.3
43
78
7
117
33
27
14
24
1.94
67593026--67593202
95
1.8
97
87
6
270
23
29
18
28
1.98
67593026--67593197
50
3.6
46
78
9
177
23
29
18
28
1.98
67596450--67596485
18
2.0
18
100
0
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33
16
5
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1.71
67600960--67601027
30
2.3
29
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32
1
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23
1.63
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2.0
79
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3
274
35
20
10
32
1.87
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112
3.1
107
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13
321
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8
7
34
1.62
67602588--67603058
112
4.4
102
73
17
296
48
8
7
36
1.60
67602858--67603115
112
2.4
104
81
12
296
45
8
10
35
1.69
67609973--67610011
17
2.3
17
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8
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0
0
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0.96
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16
3.2
16
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5
97
24
0
37
37
1.56
67613195--67613229
18
2.0
17
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5
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54
0
0
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0.99
67613204--67613400
61
3.3
61
67
13
163
48
5
1
44
1.33
67613173--67613439
120
2.2
120
93
0
444
49
4
1
44
1.31
67613315--67613349
18
2.0
17
94
5
61
51
0
0
48
1.00
67615878--67615912
18
1.9
18
100
0
70
60
0
28
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1.32
67632509--67632537
7
4.1
7
100
0
58
58
27
13
0
1.36
67636639--67636683
21
2.1
22
87
4
65
31
8
17
42
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67639147--67639358
45
4.7
45
84
1
257
35
15
20
28
1.93
67639458--67639547
34
2.6
34
83
1
108
42
16
14
26
1.87
67642479--67642510
16
2.0
16
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0
55
53
0
0
46
1.00
67645903--67645933
5
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5
100
0
62
80
0
0
19
0.71
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43
3.8
43
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2
213
29
30
15
23
1.96
67648329--67648402
31
2.4
31
84
13
100
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1
2
29
1.14
67653962--67653993
7
4.6
7
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0
55
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0
3
1.17
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0
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1.98
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2.0
29
100
0
118
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1.87
67688927--67689142
50
4.3
50
78
5
222
30
12
18
38
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          321   322   323   324   325