Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  18  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5693376--5693623
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30
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4.0
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2.0
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1.60
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49
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4
145
30
28
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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1.9
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1
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31
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35
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5771312--5771358
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2
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2.0
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10
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2.0
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28
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1.9
21
90
10
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25
25
25
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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31
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1.9
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29
24
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3.2
17
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1.9
25
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0
69
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5878775--5879850
535
2.0
535
99
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13
18
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1.89
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2.5
28
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13
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1
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1.20
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0
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2.0
24
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46
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42
1.48
5937470--5937590
39
3.1
39
97
0
224
36
23
27
12
1.91
5947330--5947389
30
2.0
30
100
0
120
40
10
23
26
1.86
5958647--5958730
30
2.8
30
81
1
107
32
16
15
35
1.90
5971052--5971086
16
2.2
16
90
10
54
25
2
8
62
1.38
5972745--5972788
6
7.3
6
86
0
52
15
4
4
75
1.14
5972745--5972785
12
3.4
12
93
0
64
17
4
4
73
1.19
5972743--5972788
18
2.6
18
85
0
65
15
6
4
73
1.19
5978240--5978375
38
3.5
38
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141
31
25
22
20
1.98
5981546--5981601
28
2.0
28
92
0
94
23
12
1
62
1.39
5982876--5982940
19
3.4
18
72
8
58
33
30
20
15
1.93
5984027--5984064
6
6.3
6
100
0
76
47
15
18
18
1.83
5993147--5993247
49
2.1
49
90
0
157
26
23
4
44
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5993845--5993904
30
2.0
30
96
0
111
28
30
5
36
1.78
5993936--5993989
23
2.2
24
84
12
67
50
22
9
18
1.75
5994520--5994561
16
2.8
15
79
10
50
21
21
4
52
1.65
5998390--5998435
18
2.6
18
96
3
85
26
8
10
54
1.64
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3.5
13
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0
2
34
1.06
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2.3
13
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5
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51
0
6
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1.28
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152
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153
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28
12
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1.75
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0
0
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13
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0
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30
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7
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1.30
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2.0
28
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0
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42
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27
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20
2.1
20
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0
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30
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1.87
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24
2.6
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20
55
44
20
15
18
1.86
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28
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1.66
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28
2.1
28
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0
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1.58
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58
1.9
58
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0
179
27
21
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1.94
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12
2.8
12
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4
52
0
20
2
77
0.90
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6
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6
100
0
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32
0
35
32
1.58
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10
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10
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64
90
10
0
0
0.47
6065044--6065083
15
2.8
15
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7
57
90
10
0
0
0.47
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47
2.0
47
100
0
190
43
8
21
27
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6071579--6071621
6
7.3
6
78
5
52
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0
0
32
0.91
6071932--6071984
15
3.0
19
68
21
60
49
11
3
35
1.57
6071914--6071984
34
2.1
34
94
0
124
47
9
4
38
1.56
6074444--6074491
9
5.4
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5
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0
0
68
0.90
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9
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60
28
0
1
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0.98
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17
1.9
17
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0
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0
0
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27
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30
0
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2.3
22
82
10
57
29
4
0
66
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325