Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  26  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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2
4
54
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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7804313--7804366
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2.0
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17
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26
1.98
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25
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7815738--7815833
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2.0
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21
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14
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56
4
3
35
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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26
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2.0
19
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1.9
24
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19
23
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7905104--7905151
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1.9
25
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129
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12
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2.2
24
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6
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12
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1.54
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4.3
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24
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62
0.96
7953525--7953697
26
6.4
26
69
19
90
35
3
1
60
1.21
7953717--7953785
16
4.2
16
73
14
52
31
2
1
63
1.18
7953719--7953785
34
2.0
34
82
11
84
31
2
1
64
1.18
7954027--7954073
18
2.5
19
75
3
51
31
2
0
65
1.04
7972008--7972373
46
8.0
46
88
0
491
40
14
24
21
1.90
7972654--7972686
17
2.0
17
88
5
50
45
3
15
36
1.61
7982402--7982433
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
7982403--7982433
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
7986856--7986887
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
7986857--7986887
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
7993997--7994052
15
3.6
16
83
7
71
25
8
8
57
1.58
7995412--7995445
16
2.1
16
94
0
59
32
17
20
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8001810--8001853
17
2.6
18
78
10
56
47
2
0
50
1.13
8023241--8023269
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
8024583--8024619
19
1.9
19
100
0
74
59
5
16
18
1.55
8026955--8026980
6
4.3
6
100
0
52
19
15
30
34
1.93
8033036--8033092
23
2.5
23
86
8
73
14
7
40
38
1.73
8033783--8034010
127
1.8
126
84
2
314
35
23
15
25
1.94
8034039--8034374
71
4.5
76
89
5
431
32
19
15
31
1.93
8034079--8034392
143
2.2
144
85
8
422
36
18
14
30
1.91
8034268--8034502
122
1.9
124
85
3
323
35
20
14
28
1.93
8034392--8034565
69
2.5
71
85
5
214
33
22
14
29
1.94
8047753--8047806
23
2.4
23
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9
67
14
7
40
37
1.74
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18
2.2
18
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4
53
56
2
0
41
1.13
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19
3.3
19
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4
54
46
0
3
50
1.17
8056652--8056712
26
2.3
27
77
8
63
68
9
3
18
1.31
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56
2.0
56
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0
217
28
22
21
28
1.99
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17
2.0
17
88
0
50
32
5
0
61
1.20
8069069--8069125
26
2.1
27
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3
80
31
5
1
61
1.28
8069355--8069417
25
2.5
24
84
10
72
30
1
7
60
1.35
8069376--8069431
25
2.3
25
87
3
78
30
5
5
58
1.42
8074107--8074191
5
16.8
5
77
11
59
81
5
12
0
0.87
8074100--8074192
22
4.2
21
70
18
82
81
6
11
0
0.86
8074098--8074191
39
2.5
37
80
16
104
81
6
11
0
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8078630--8078662
16
2.0
17
88
5
50
48
0
0
51
1.00
8081605--8081645
18
2.3
18
86
0
55
39
7
17
36
1.77
8082130--8082171
21
2.0
21
100
0
84
66
0
0
33
0.92
8086708--8086753
24
1.9
24
100
0
92
36
36
8
17
1.81
8087803--8087838
18
2.0
18
89
10
56
16
33
5
44
1.71
8089728--8089760
6
5.7
6
85
7
50
12
3
0
84
0.72
8089727--8089759
17
1.9
17
100
0
66
12
3
0
84
0.72
8089694--8089772
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10
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13
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22
2
1
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1.03
8093643--8093692
15
3.5
15
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15
61
22
24
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42
1.87
8102430--8102773
179
1.9
178
84
9
461
32
20
19
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325