Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  32  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9482000--9482026
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0
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29
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26
6
0
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1.21
9482515--9482670
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43
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1.24
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5
5
58
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
130
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140
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2.0
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2
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2.3
26
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19
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5
5
58
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4.3
43
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0
100
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241
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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168
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22
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1.9
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1.18
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0
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0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9614552--9614614
23
2.8
23
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2
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22
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2.0
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27
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25
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1.96
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19
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0
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10
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1.94
9635493--9635604
54
2.1
54
85
6
147
16
24
22
36
1.94
9641094--9641358
71
3.8
71
70
6
189
33
23
18
25
1.97
9640840--9641623
70
11.2
70
74
6
464
31
22
18
26
1.97
9640906--9641504
211
2.8
208
75
7
589
31
22
18
26
1.97
9640841--9641623
140
5.6
139
75
6
535
31
22
18
26
1.97
9640919--9641691
422
1.8
419
79
6
891
31
23
18
27
1.97
9642668--9642721
24
2.2
24
83
0
72
24
25
16
33
1.96
9644574--9644636
33
1.9
33
86
0
90
25
17
38
19
1.93
9646979--9647023
13
3.3
14
77
22
51
60
0
4
35
1.17
9647877--9647915
20
2.0
20
94
0
69
30
23
20
25
1.98
9650291--9650327
17
2.2
17
90
0
56
18
13
16
51
1.76
9650342--9650378
3
12.3
3
94
0
65
0
29
0
70
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9652277--9652308
15
2.1
15
94
0
55
15
6
21
56
1.62
9652735--9652789
22
2.5
22
82
2
67
47
1
1
49
1.23
9655934--9655966
8
4.1
8
96
0
57
33
0
0
66
0.92
9657319--9657508
96
2.0
96
100
0
380
27
22
16
33
1.96
9663250--9663286
13
2.8
13
91
0
56
29
0
0
70
0.88
9664380--9664466
27
3.0
27
76
15
84
27
3
17
51
1.61
9664407--9664499
32
2.9
32
91
0
150
27
4
16
51
1.63
9665445--9665504
29
2.1
29
100
0
120
30
10
21
38
1.86
9665764--9665821
24
2.4
24
79
2
71
53
0
1
44
1.10
9665896--9665936
19
2.1
20
90
4
66
48
12
9
29
1.72
9665920--9665965
14
3.2
14
87
3
56
39
15
10
34
1.82
9668245--9668293
14
3.4
15
86
8
75
34
0
12
53
1.39
9668234--9668291
29
2.1
27
90
6
89
32
0
13
53
1.40
9668665--9668751
21
4.0
23
80
10
92
14
21
25
37
1.92
9676945--9676983
19
2.1
19
90
0
60
46
12
23
17
1.83
9684042--9684253
104
2.0
105
93
1
363
25
10
18
45
1.81
9701528--9701557
6
5.0
6
100
0
60
16
16
33
33
1.92
9708073--9708329
127
2.0
127
84
4
340
52
16
14
16
1.74
9710754--9710787
5
7.0
5
86
6
52
55
0
2
41
1.15
9710754--9710787
14
2.4
14
90
5
50
55
0
2
41
1.15
9714422--9714482
31
2.0
31
83
0
77
42
9
1
45
1.47
9715871--9715962
44
2.1
44
95
0
166
31
5
4
58
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9716005--9716042
19
2.0
20
84
5
51
28
2
7
60
1.38
9719260--9719302
14
3.1
14
77
12
52
55
2
2
39
1.25
9724637--9724709
36
2.0
36
82
12
87
26
4
15
54
1.58
9733557--9733581
12
2.1
12
100
0
50
60
0
0
40
0.97
9738628--9738677
22
2.5
20
78
15
59
48
2
2
48
1.24
9739808--9739832
8
3.1
8
100
0
50
64
12
0
24
1.27
9742076--9742121
20
2.3
20
96
0
83
47
4
17
30
1.67
9742529--9742695
85
2.0
85
98
0
325
34
11
22
31
1.90
9756293--9756330
20
1.9
20
94
0
67
50
0
5
44
1.24
9757722--9757781
18
3.3
18
79
9
68
40
11
15
33
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325