Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  9  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2596441--2596560
61
2.0
62
80
5
136
39
5
13
42
1.66
2601849--2601884
11
3.2
11
88
4
54
77
0
22
0
0.76
2602536--2602579
17
2.7
16
86
13
63
36
0
20
43
1.52
2602536--2602594
18
3.5
17
82
15
61
38
0
18
42
1.51
2604770--2604816
16
2.9
16
79
20
53
10
12
6
70
1.33
2604777--2604826
16
3.1
15
80
11
55
12
10
4
74
1.21
2605671--2605952
26
11.0
26
66
15
113
30
7
3
58
1.44
2606086--2606163
26
3.2
24
77
13
70
30
5
2
61
1.31
2606110--2606176
24
2.7
26
81
9
77
31
4
0
64
1.14
2606305--2606329
13
1.9
13
100
0
50
36
8
0
56
1.29
2611464--2611501
17
2.2
17
86
9
51
28
0
2
68
1.03
2618352--2618398
24
2.0
24
83
8
60
74
4
2
19
1.09
2618469--2618510
13
3.2
13
80
9
50
78
4
0
16
0.91
2629002--2629065
28
2.3
28
83
5
76
25
18
26
29
1.98
2642274--2642327
21
2.6
21
84
0
72
20
33
33
12
1.91
2644408--2644435
12
2.3
12
100
0
56
60
0
0
39
0.97
2647039--2647205
91
1.8
91
85
2
237
35
18
19
26
1.95
2647133--2648860
75
21.9
78
74
13
462
32
18
16
32
1.93
2647214--2647388
88
2.0
88
87
4
255
37
16
15
30
1.90
2647772--2648866
75
14.1
74
78
12
884
32
19
16
31
1.93
2647045--2649030
627
3.1
626
87
6
2616
33
18
16
31
1.93
2648791--2648956
90
1.8
91
90
1
271
33
18
15
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2648876--2649026
77
2.0
77
91
0
248
30
18
17
33
1.94
2648719--2649030
165
1.9
164
88
2
471
32
17
15
34
1.92
2657377--2657412
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
2661915--2661983
33
2.2
31
87
10
95
40
0
7
52
1.29
2661915--2662003
33
2.8
32
81
13
87
40
0
7
51
1.31
2663082--2663118
18
2.1
18
100
0
74
43
5
10
40
1.63
2665623--2665651
11
2.6
11
100
0
58
37
17
10
34
1.84
2670093--2670146
3
17.3
3
79
11
56
62
1
3
31
1.23
2670353--2670403
3
17.3
3
83
4
59
58
0
7
33
1.27
2670736--2670829
37
2.8
32
74
19
100
58
6
4
30
1.42
2670752--2670814
17
3.5
17
72
10
54
57
6
6
30
1.49
2670940--2670984
23
2.0
23
91
8
74
51
11
0
37
1.38
2671716--2671756
18
2.3
18
87
8
57
75
0
9
14
1.04
2671715--2671757
21
2.0
22
86
4
61
74
0
9
16
1.06
2674723--2674813
32
2.9
32
83
3
105
37
3
9
49
1.53
2685653--2685686
14
2.5
14
85
4
52
5
11
11
70
1.32
2703192--2703264
35
2.1
35
94
0
128
34
15
6
43
1.73
2703956--2703994
19
2.0
20
85
5
53
46
2
0
51
1.14
2705971--2706039
31
2.2
32
80
12
81
33
17
10
39
1.83
2708296--2708362
33
2.0
33
91
0
107
32
14
11
40
1.83
2711547--2711588
18
2.3
19
79
4
50
14
23
0
61
1.32
2712332--2712391
31
2.0
31
87
6
88
61
0
3
35
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2722245--2722301
30
1.9
30
100
0
114
43
7
19
29
1.77
2726137--2726345
55
3.7
55
78
3
193
28
6
13
51
1.65
2726196--2726345
57
2.7
55
82
2
174
30
5
14
50
1.64
2726140--2726345
112
1.8
113
81
1
261
29
5
13
51
1.64
2726515--2726895
190
2.0
189
93
0
654
26
19
19
34
1.96
2736086--2736119
13
2.4
14
85
14
52
0
11
14
73
1.10
2744492--2744538
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
2750145--2750183
15
2.5
15
87
4
51
41
0
2
56
1.13
2750135--2750181
16
2.7
18
78
18
55
44
0
2
53
1.12
2750414--2750455
22
1.9
22
85
0
57
45
0
2
52
1.13
2752079--2752123
23
2.0
23
82
8
56
48
6
0
44
1.29
2755017--2755079
32
2.0
32
96
0
117
44
6
0
49
1.28
2755401--2755441
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
2755664--2755697
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
2758779--2758875
22
4.5
22
77
2
97
43
22
23
10
1.84
2758779--2758875
43
2.2
44
79
3
115
43
22
23
10
1.84
2765084--2765117
17
2.0
17
100
0
68
41
17
11
29
1.85
2765552--2765602
24
2.2
24
82
10
61
27
5
3
62
1.36
2770893--2770927
16
2.2
16
89
0
52
57
0
28
14
1.38
2773748--2773787
21
1.9
21
89
0
62
17
2
5
75
1.10
2792220--2792245
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
2805619--2805669
27
2.0
27
84
7
70
64
5
0
29
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2805660--2805699
12
3.6
12
74
19
50
72
12
0
15
1.12
2805649--2805699
21
2.4
22
87
9
70
72
11
0
15
1.12
2808727--2808766
21
2.0
20
90
5
62
37
17
17
27
1.92
2815025--2815050
9
2.9
9
100
0
52
69
7
0
23
1.14
2815022--2815080
21
2.9
19
75
18
57
67
5
0
27
1.11
2820069--2820112
19
2.3
19
84
11
54
54
2
9
34
1.44
2820609--2820658
24
2.1
24
82
14
59
22
26
18
34
1.96
2820786--2820868
25
3.4
25
69
12
64
19
24
18
38
1.93
2823444--2823533
31
3.0
31
72
4
87
38
20
17
23
1.93
2825296--2825365
23
3.0
23
74
12
63
52
0
1
45
1.09
2826416--2826474
32
1.9
31
83
10
77
54
11
1
32
1.47
2826911--2826953
22
2.0
22
90
4
70
53
0
2
44
1.13
2826929--2826988
29
2.0
31
83
9
79
38
1
8
51
1.42
2829613--2829637
12
2.1
12
100
0
50
52
0
0
48
1.00
2835003--2835041
17
2.3
17
86
0
51
74
0
20
5
1.01
2836019--2836085
34
2.0
34
87
0
98
31
5
19
43
1.75
2840344--2840400
27
2.1
28
80
9
64
35
0
8
56
1.31
2840387--2840424
18
2.2
18
85
4
51
50
0
2
47
1.15
2845134--2845215
29
2.9
30
82
7
91
56
0
2
41
1.13
2845147--2845179
12
2.9
12
91
8
52
54
0
0
45
0.99
2845186--2845221
17
2.2
17
90
5
56
61
0
2
36
1.11
2846285--2846373
38
2.2
41
86
5
121
52
4
3
39
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2846519--2846550
17
1.9
16
93
6
55
56
0
3
40
1.15
2847282--2847333
24
2.2
24
100
0
104
30
3
30
34
1.76
2855647--2855689
14
3.1
14
80
10
52
83
0
16
0
0.64
2856692--2856782
40
2.2
41
84
5
114
51
7
4
36
1.51
2857971--2858011
6
6.8
6
88
8
57
53
0
2
43
1.13
2863265--2863328
29
2.2
29
81
10
78
18
15
6
59
1.57
2863340--2863411
3
24.3
3
75
8
67
31
2
4
61
1.29
2876009--2876522
44
11.9
43
71
13
247
31
18
21
28
1.97
2876050--2876461
128
3.2
129
94
1
711
30
18
21
29
1.97
2877921--2877984
29
2.2
29
81
10
78
18
15
6
59
1.57
2877996--2878070
3
25.3
3
76
8
73
32
2
4
61
1.28
2885226--2885267
21
2.0
21
90
4
68
26
4
0
69
1.08
2885235--2885279
21
2.3
19
85
14
56
26
4
2
66
1.22
2885241--2885301
27
2.3
26
78
18
63
26
6
1
65
1.26
2885394--2885450
3
19.3
3
75
10
55
33
7
0
59
1.24
2885399--2885450
9
5.6
9
80
17
61
34
5
0
59
1.21
2885415--2885527
15
7.5
14
75
24
72
30
6
1
61
1.30
2885450--2885495
14
3.2
14
90
9
67
28
6
0
65
1.17
2885633--2886058
3
144.7
3
71
12
217
30
6
2
60
1.34
2885845--2885907
26
2.3
26
84
13
74
28
4
1
65
1.22
2888914--2888948
18
1.9
18
94
0
61
74
0
2
22
0.95
2894766--2894799
17
1.9
18
94
5
61
73
0
2
23
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2897518--2897566
23
2.0
23
84
7
62
51
0
4
44
1.20
2900831--2900855
10
2.5
10
100
0
50
20
8
0
72
1.10
2928449--2928505
28
2.0
28
86
0
78
36
29
7
26
1.83
2928459--2928502
21
2.1
21
82
0
52
38
31
6
22
1.81
2929308--2929348
21
2.0
21
90
0
64
12
26
0
60
1.31
2933097--2933179
39
2.1
39
93
0
139
22
20
26
30
1.98
2940151--2940243
45
2.1
45
95
0
168
20
19
22
37
1.94
2944561--2944624
3
20.7
3
87
6
92
29
3
1
65
1.17
2944720--2944788
25
3.2
20
78
17
61
34
2
5
56
1.38
2945154--2945182
3
9.7
3
100
0
58
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325