Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  272  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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100
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3.7
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4
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7
32
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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71
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1.96
89133616--89133774
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124
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23
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18
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15
22
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.1
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16
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1.96
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1.96
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31
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89205866--89205921
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17
21
1.92
89216178--89216228
21
2.5
20
84
12
59
35
3
1
58
1.28
89217077--89217123
24
2.0
24
83
8
60
57
27
6
8
1.53
89217089--89217264
88
2.0
88
100
0
352
38
17
10
34
1.83
89221092--89221188
40
2.5
40
81
3
117
38
35
14
12
1.84
89223258--89223416
33
4.8
33
77
5
144
46
17
16
18
1.84
89223258--89223418
66
2.5
66
84
1
198
47
17
16
18
1.83
89224489--89224523
17
2.1
17
88
0
52
40
34
0
25
1.56
89234428--89234912
243
2.0
244
92
0
819
27
22
22
27
1.99
89240857--89240911
29
1.9
29
85
10
78
16
20
41
21
1.90
89241668--89241823
43
3.6
43
87
1
215
28
20
18
32
1.96
89242333--89242388
27
2.1
27
96
0
103
28
0
21
50
1.49
89244163--89244224
31
2.0
31
100
0
124
38
29
19
12
1.89
89249972--89250018
20
2.3
21
79
20
55
68
8
14
8
1.39
89251550--89251581
13
2.5
13
94
0
55
0
18
0
81
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89252885--89252925
22
2.0
20
85
9
55
7
14
0
78
0.96
89263156--89263331
46
3.8
46
78
14
200
20
19
29
30
1.97
89263153--89263324
93
1.8
93
93
2
301
20
20
29
29
1.98
89268179--89268215
12
3.1
12
88
11
58
16
0
27
56
1.40
89271354--89271403
13
3.7
13
81
7
55
70
0
30
0
0.88
89271350--89271404
23
2.4
24
78
9
60
67
0
32
0
0.91
89272064--89272116
22
2.6
20
76
8
54
32
0
7
60
1.25
89271739--89272281
205
2.6
207
85
8
727
29
1
14
55
1.46
89271739--89272282
208
2.6
208
84
9
729
29
1
14
55
1.46
89271739--89272285
102
5.3
104
80
8
538
29
1
14
55
1.46
89274352--89274452
46
2.2
46
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11
138
16
44
11
26
1.83
89274620--89274810
75
2.6
73
83
8
217
28
5
12
52
1.62
89278054--89278110
25
2.3
25
93
3
98
29
19
17
33
1.95
89278160--89278200
21
1.9
22
90
5
66
75
2
0
21
0.92
89279107--89279141
2
17.5
2
87
0
52
45
2
2
48
1.32
89281497--89281542
21
2.1
22
88
4
67
19
23
26
30
1.98
89287447--89287482
18
2.0
18
94
0
63
38
13
22
25
1.91
89289838--89289866
7
4.3
7
91
8
51
55
0
0
44
0.99
89290551--89290607
17
3.4
16
77
15
53
68
0
22
8
1.17
89292433--89292488
22
2.5
22
85
5
69
23
32
26
17
1.97
89292453--89292495
22
2.0
22
85
0
59
23
32
27
16
1.96
89294780--89294832
21
2.5
22
76
11
56
32
18
7
41
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89295080--89295189
58
1.9
58
81
5
134
28
22
20
28
1.99
89295433--89295478
17
2.7
18
76
10
60
19
15
21
43
1.87
89303921--89303969
25
2.0
25
87
0
71
26
26
20
26
1.99
89306741--89306839
28
3.5
28
87
4
119
27
15
27
30
1.96
89309604--89309636
17
2.0
17
88
5
50
54
0
3
42
1.15
89309606--89309658
4
12.8
4
76
7
52
49
1
1
47
1.23
89313477--89313595
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2.0
61
88
3
177
21
16
37
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1.93
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23
1.9
23
81
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29
11
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1.63
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2.1
33
94
0
122
30
18
15
35
1.92
89325742--89325918
50
3.5
50
91
0
273
36
16
22
24
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325