Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  48  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14375073--14375192
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2.2
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16
1.91
Indices
Period
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Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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24
3.1
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42
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38
13
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14569157--14569225
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47
1.40
14586787--14586932
40
3.6
40
86
1
193
26
17
23
32
1.96
14586787--14586893
41
2.7
40
91
1
160
26
18
23
31
1.97
14588147--14588531
145
2.6
144
83
6
470
42
9
5
42
1.60
14588701--14588725
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
14597919--14597990
17
4.0
17
72
16
56
29
4
0
66
1.10
14597922--14597977
29
1.9
29
85
0
76
30
5
0
64
1.16
14597958--14598006
12
4.2
12
73
21
50
30
0
4
65
1.11
14597960--14598002
21
2.0
21
86
0
59
27
0
4
67
1.10
14601752--14601963
105
2.0
105
100
0
424
33
10
20
34
1.87
14608144--14608179
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
14608347--14608427
21
3.8
20
77
6
72
33
25
24
16
1.96
14608333--14608438
42
2.5
43
81
6
135
36
24
21
16
1.94
14608359--14608428
21
3.2
21
91
4
113
32
27
25
14
1.94
14608797--14608837
15
2.8
14
89
10
64
48
12
0
39
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14608993--14609022
2
15.0
2
100
0
60
50
50
0
0
1.00
14609819--14609851
9
3.7
9
92
8
50
6
12
3
78
1.04
14613385--14613673
44
6.5
44
79
6
287
30
16
27
25
1.97
14613890--14613928
8
4.9
8
90
0
51
79
0
2
17
0.84
14615256--14615355
7
13.6
7
69
18
53
32
1
2
65
1.11
14615414--14615480
24
2.9
24
71
4
57
32
4
0
62
1.15
14615452--14615512
11
5.8
11
73
21
51
31
1
3
63
1.20
14615456--14615512
21
2.8
19
80
15
69
31
1
3
63
1.22
14627674--14627712
20
2.0
20
89
0
60
46
17
10
25
1.80
14638083--14638212
47
2.8
47
84
4
156
21
15
28
34
1.94
14643302--14643349
25
1.9
25
95
0
87
35
14
16
33
1.89
14643630--14643722
24
3.8
24
77
5
80
31
18
23
26
1.97
14652681--14652705
4
6.2
4
100
0
50
24
0
24
52
1.48
14653822--14653882
25
2.4
27
75
8
65
59
0
11
29
1.33
14668309--14668367
26
2.3
26
90
0
91
35
23
6
33
1.82
14669889--14669979
23
3.9
23
89
2
137
35
17
24
23
1.95
14684275--14684309
11
3.1
12
88
12
56
48
0
51
0
1.00
14685486--14686416
175
5.3
175
87
3
1106
29
26
16
26
1.97
14685411--14686374
307
3.1
308
87
2
1418
29
26
16
26
1.97
14685411--14686411
132
7.6
133
87
2
969
29
26
16
26
1.97
14707548--14707572
13
1.9
13
100
0
50
8
40
36
16
1.77
14721089--14721147
26
2.3
26
90
0
91
35
23
6
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14728496--14728545
20
2.5
21
72
21
52
34
16
12
38
1.85
14741685--14741721
15
2.5
15
90
0
56
54
13
8
24
1.66
14743475--14743540
23
2.9
22
80
8
71
34
15
21
28
1.93
14746604--14746711
27
4.0
27
84
8
139
37
22
24
15
1.93
14746604--14746711
54
2.0
54
87
3
155
37
22
24
15
1.93
14748123--14748191
23
3.0
23
89
2
102
24
39
1
34
1.65
14754406--14754518
27
4.2
26
79
11
120
38
22
23
15
1.92
14754406--14754518
54
2.1
54
86
6
158
38
22
23
15
1.92
14755934--14756004
24
3.0
24
91
0
115
23
38
2
35
1.70
14756445--14756477
14
2.3
15
89
5
50
24
30
0
45
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325