Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  122  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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0
15
48
1.45
39302141--39302184
22
2.0
22
95
0
79
25
36
4
34
1.76
39303157--39303202
18
2.5
19
79
6
51
65
2
26
6
1.28
39308532--39308587
12
4.7
12
74
14
53
64
0
23
12
1.27
39320637--39320696
18
3.2
18
75
11
66
6
16
3
73
1.18
39336493--39336547
20
2.8
20
88
0
83
25
29
16
29
1.97
39343241--39343306
20
3.3
19
72
16
53
39
16
21
22
1.92
39343232--39343306
30
2.5
30
87
8
100
40
18
20
21
1.92
39344361--39344457
30
3.2
31
75
5
101
27
27
15
28
1.96
39352830--39353006
27
6.6
27
83
5
205
27
14
28
29
1.95
39352831--39352985
81
1.9
80
88
3
231
27
14
28
29
1.95
39363150--39363188
10
3.8
10
89
3
60
79
2
7
10
1.02
39363151--39363188
20
1.9
20
94
0
67
78
2
7
10
1.04
39363150--39363188
11
3.7
11
83
13
55
79
2
7
10
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39372410--39372447
12
3.2
12
84
0
58
15
7
2
73
1.17
39372399--39372445
24
2.0
24
83
8
60
10
10
6
72
1.28
39373960--39374003
20
2.2
20
91
0
70
22
9
36
31
1.86
39374270--39374321
27
1.9
27
84
0
68
65
1
25
7
1.30
39379494--39379535
18
2.4
18
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7
61
69
0
23
7
1.13
39386488--39386531
22
2.0
22
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0
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4
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25
1.76
39388797--39388843
21
2.2
22
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3
60
14
25
2
57
1.49
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14
3.3
14
84
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65
48
13
0
37
1.42
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42
2.5
42
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1
194
41
13
12
33
1.81
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11
5.7
10
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11
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15
3
1
79
0.94
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24
2.4
23
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2
60
42
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22
1.71
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20
2.7
20
73
0
54
20
25
20
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1.97
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15
2.4
15
100
0
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27
0
11
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1.30
39413914--39413982
10
6.0
12
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21
51
15
8
4
71
1.28
39413934--39413981
10
4.7
10
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2
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14
8
2
75
1.13
39433904--39433960
29
2.0
29
86
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80
22
1
31
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1.64
39434377--39434423
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91
39441481--39441598
55
2.1
55
84
6
159
25
22
13
38
1.90
39442222--39442276
20
2.8
20
88
0
83
29
14
29
27
1.95
39443166--39443195
16
1.9
15
93
6
51
43
33
3
20
1.68
39443684--39443721
15
2.4
16
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8
60
10
18
0
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23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39449360--39449414
20
2.8
20
88
0
83
29
16
29
25
1.97
39457315--39457375
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
39457316--39457376
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
39459442--39459475
18
1.9
18
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5
52
23
20
0
55
1.43
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6
17.2
6
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9
52
7
17
3
71
1.25
39459514--39459567
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9.2
6
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4
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3
14
5
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1.12
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21
2.0
21
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1.00
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12
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13
2
8
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1.13
39466742--39466802
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325