Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  23  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7095695--7096159
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2.2
209
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2
808
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3
5
35
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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2
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2.2
20
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0
4
31
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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30
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1.48
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2.0
20
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0
62
27
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0
65
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7176556--7176670
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10
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1.20
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9
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1.28
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1.96
7191040--7191082
18
2.5
17
80
3
50
27
11
4
55
1.55
7191169--7191460
3
99.3
3
67
12
72
29
9
1
59
1.35
7191220--7191299
41
2.0
41
85
5
108
30
10
1
58
1.38
7191379--7191445
26
2.5
26
80
7
80
25
5
0
68
1.12
7191591--7191625
18
1.9
18
88
0
52
22
8
8
60
1.54
7195636--7195677
17
2.5
16
75
24
50
59
2
0
38
1.10
7195668--7195699
11
2.9
11
95
0
55
56
6
0
37
1.25
7196081--7196124
22
2.0
22
90
0
70
50
0
0
50
1.00
7196081--7196136
22
2.6
22
86
5
62
46
0
0
53
1.00
7196149--7196179
15
2.0
16
93
6
55
61
0
0
38
0.96
7196218--7196274
15
3.5
15
71
17
51
49
1
1
47
1.22
7196731--7196768
14
2.7
14
91
0
58
31
18
10
39
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7198188--7198217
14
2.1
14
93
0
51
50
0
10
40
1.36
7198424--7198465
20
2.1
20
100
0
84
59
0
0
40
0.97
7198621--7198677
31
1.9
31
82
10
75
61
3
1
33
1.23
7199088--7199173
39
2.2
39
100
0
172
29
23
22
25
1.99
7200465--7200507
18
2.3
19
92
4
70
34
0
0
65
0.93
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18
6.3
19
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15
57
36
3
5
53
1.42
7200454--7200571
18
6.2
20
69
13
56
38
2
5
53
1.37
7205376--7205425
15
3.3
15
78
8
57
56
2
0
42
1.11
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15
2.3
15
90
0
52
48
0
0
51
1.00
7209114--7209180
31
2.1
32
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5
100
38
4
7
49
1.51
7216567--7216752
102
1.9
98
85
4
255
28
16
24
31
1.96
7217018--7217043
12
2.2
12
100
0
52
0
7
15
76
0.99
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44
3.5
44
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0
241
49
12
1
36
1.52
7220010--7220079
22
3.2
22
67
15
63
50
14
0
35
1.43
7220348--7220398
6
8.8
6
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6
52
56
0
25
17
1.41
7220117--7220361
50
5.1
49
89
7
369
63
0
13
22
1.35
7220115--7220361
96
2.6
95
90
5
376
63
0
13
22
1.35
7220545--7220610
25
2.7
25
76
4
73
46
1
9
42
1.44
7220664--7220705
21
2.0
21
90
0
66
61
0
14
23
1.32
7220790--7220828
5
7.2
5
83
16
51
56
0
17
25
1.41
7220813--7220850
18
2.1
19
85
5
51
44
0
23
31
1.54
7220878--7220943
17
3.9
17
80
6
71
65
3
15
16
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7220874--7220944
33
2.1
33
86
2
97
64
2
14
18
1.40
7220875--7220954
18
4.5
18
74
15
60
62
2
13
21
1.43
7220907--7220957
18
2.9
17
82
8
66
68
0
9
21
1.18
7223549--7223828
91
3.1
90
82
5
316
52
16
7
24
1.68
7233955--7234001
23
2.0
25
87
8
71
57
17
4
21
1.56
7235962--7236010
24
2.0
24
96
0
89
42
6
16
34
1.73
7237729--7237799
37
1.9
37
94
0
124
30
14
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2.2
12
100
0
52
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0
0
57
0.98
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3.9
9
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0
52
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5
37
1.80
7250994--7251029
3
12.0
3
87
0
54
27
33
2
36
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325