Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  303  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98457070--98457113
19
2.2
20
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4
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1
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2
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2.1
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1.15
98472661--98472712
9
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1
0
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1.06
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33
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2
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1.32
98472681--98472757
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5.6
14
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3
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63
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2.4
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1
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1.62
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489
28
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2.0
220
97
0
825
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5
19
30
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.9
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1
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1.98
98509300--98509616
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20
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1.98
98510426--98510556
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2.4
55
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29
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28
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2
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1.40
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2.1
43
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1.87
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32
1.81
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2.6
42
78
11
123
34
5
29
30
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
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124
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0.99
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10
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12
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4
79
1.02
98540957--98541002
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1.9
24
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10
4
6
78
1.08
98540865--98540984
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13
8
2
75
1.12
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29
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2
108
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1
4
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1.31
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11
1.07
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10
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115
1.8
112
83
8
274
33
20
16
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98577016--98577047
5
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5
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0
0
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0.70
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0
0
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0.71
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93
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59
81
0
0
18
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2.2
14
100
0
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80
0
0
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0
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0
0
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4.9
48
72
10
191
28
24
20
26
1.99
98593967--98594087
47
2.5
48
81
2
145
28
22
22
27
1.99
98595831--98595876
25
1.9
25
82
8
60
28
15
2
54
1.53
98596138--98596273
46
3.0
47
87
2
179
22
23
14
39
1.91
98611879--98611914
18
2.0
18
100
0
72
11
11
27
50
1.72
98613463--98613500
3
12.7
3
94
0
67
31
0
2
65
1.06
98613550--98613633
21
4.0
21
77
16
70
65
0
7
27
1.18
98613576--98613621
24
1.9
24
86
8
67
63
0
6
30
1.20
98613623--98613664
17
2.5
17
82
17
52
71
0
11
16
1.14
98615636--98615684
14
3.6
14
74
20
59
48
12
18
20
1.79
98615749--98615887
44
3.2
44
73
2
127
31
19
20
28
1.97
98615828--98616029
95
2.1
96
81
2
237
33
16
18
30
1.94
98615878--98616050
95
1.8
95
79
2
204
32
19
17
30
1.95
98615975--98616120
50
2.9
51
73
11
147
34
19
19
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98616073--98616158
44
2.0
44
88
0
127
33
18
20
26
1.96
98616222--98616320
44
2.2
45
80
5
112
32
13
21
33
1.91
98616703--98616754
24
2.2
24
100
0
104
28
3
25
42
1.72
98623662--98623709
24
2.0
24
88
8
71
12
27
2
58
1.46
98626935--98626988
23
2.3
23
84
6
74
50
3
0
46
1.19
98630214--98630244
16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
98630324--98630354
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
98637848--98637878
16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
98637959--98637989
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
98639101--98639143
23
2.0
23
86
9
63
11
9
39
39
1.74
98648260--98648326
30
2.2
30
84
5
82
64
4
2
28
1.28
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13
2.8
13
87
0
56
32
0
0
67
0.91
98650597--98650728
61
2.2
61
97
0
246
36
20
9
33
1.86
98660104--98660131
12
2.3
12
100
0
56
53
0
14
32
1.41
98660843--98660879
19
2.0
18
89
5
56
29
5
2
62
1.31
98664579--98664655
27
2.9
27
86
9
113
37
22
23
16
1.94
98665097--98665138
21
2.0
21
85
0
57
38
26
0
35
1.57
98665108--98665140
11
3.1
11
86
8
50
33
36
0
30
1.58
98685498--98685554
30
1.9
30
88
0
87
31
14
15
38
1.87
98697354--98697387
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
98705674--98705718
21
2.1
21
84
8
56
40
20
22
17
1.92
98712630--98712666
15
2.5
14
87
12
56
89
0
2
8
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98713484--98714196
135
5.3
135
90
0
1057
29
20
22
26
1.99
98715886--98716061
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
98715883--98716054
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
98718520--98718562
17
2.5
17
82
10
52
27
4
4
62
1.35
98720523--98720567
18
2.6
17
79
6
54
51
0
0
48
1.00
98720528--98720584
27
2.1
27
84
12
73
57
0
1
40
1.09
98727046--98727079
16
2.1
16
88
0
50
41
14
0
44
1.45
98730574--98730659
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2.3
37
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11
95
37
11
6
44
1.68
98732478--98732530
16
3.3
16
73
7
54
1
15
7
75
1.11
98732540--98732630
5
18.4
5
76
15
91
54
2
1
41
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325