Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  296  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96560179--96560401
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2
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24
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2.4
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18
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1.9
81
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5
199
19
17
21
41
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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177
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18
18
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18
18
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13
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0
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63
1.09
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52
20
8
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2.0
836
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3.0
16
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36
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.04
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15.5
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1.91
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4.2
46
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0
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43
16
21
19
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96685272--96685525
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18
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0
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18
13
48
1.80
96694223--96694505
54
5.1
54
74
9
228
36
12
15
36
1.85
96694223--96694518
36
8.0
36
72
10
213
35
11
15
36
1.84
96694223--96694518
18
16.1
18
74
8
184
35
11
15
36
1.84
96696613--96696766
48
3.2
48
92
1
254
31
27
12
27
1.93
96698969--96699014
18
2.5
19
79
10
51
58
0
6
34
1.24
96699134--96699216
11
7.5
11
75
17
82
57
9
0
32
1.31
96699137--96699216
21
3.6
21
73
19
65
57
10
0
32
1.32
96699424--96699456
12
2.8
12
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0
57
48
0
9
42
1.35
96700772--96700886
44
2.6
44
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2
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29
20
19
30
1.97
96700882--96701062
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2.1
88
88
0
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27
16
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34
1.95
96701036--96701590
87
6.4
86
86
5
724
20
22
21
35
1.96
96701028--96701590
173
3.2
172
86
6
767
19
22
21
35
1.96
96701035--96701542
44
11.6
44
69
10
328
19
22
21
35
1.96
96714066--96714156
11
8.0
11
73
20
71
57
8
1
32
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96714074--96714156
21
3.7
21
79
9
67
57
8
1
32
1.36
96724338--96724386
23
2.1
23
100
0
98
34
14
12
38
1.83
96728713--96728744
9
3.6
9
100
0
64
12
0
9
78
0.97
96728822--96728870
23
2.1
23
100
0
98
34
14
12
38
1.83
96747898--96747945
22
2.2
22
88
0
69
14
16
4
64
1.43
96752230--96752280
21
2.6
19
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7
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1
58
1.37
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41
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163
30
17
24
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1.97
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29
2.1
29
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5
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12
22
1.73
96761395--96761471
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2.0
38
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0
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1.95
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2.9
48
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1
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20
15
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1.94
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6.2
6
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33
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2.9
40
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35
15
9
40
1.79
96778700--96778805
28
3.7
27
73
19
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26
27
18
27
1.98
96778705--96778844
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2.3
60
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8
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27
27
18
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1.98
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2.7
31
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143
28
26
15
28
1.96
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25
2.8
26
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21
25
29
1.99
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27
1.9
27
88
7
79
34
11
13
40
1.81
96783054--96783175
27
4.6
27
72
6
95
29
6
19
44
1.76
96783196--96783298
27
3.8
26
82
6
82
41
7
20
30
1.80
96783207--96783298
27
3.4
27
87
0
130
42
6
21
29
1.78
96784629--96784770
60
2.3
60
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144
27
24
19
28
1.99
96787925--96787954
4
7.5
4
100
0
60
23
0
0
76
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96790365--96790425
29
2.1
30
93
3
106
49
0
22
27
1.50
96793118--96793143
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2.0
13
100
0
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30
15
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30
1.95
96797784--96797814
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2.4
13
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0
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19
1.76
96800398--96800423
13
2.0
13
100
0
52
30
15
23
30
1.95
96800585--96800675
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3.6
25
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2
112
31
24
24
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1.98
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17
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100
0
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3
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2
116
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1
1
36
1.13
96807841--96808160
146
2.2
147
82
1
392
21
30
23
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325