Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  305  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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20
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19
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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33
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0
171
31
41
10
17
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99242813--99242860
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1.9
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6
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1.31
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1.15
99271764--99271835
35
2.1
35
97
0
135
48
8
8
34
1.63
99288117--99288179
30
2.0
32
81
6
76
46
0
1
52
1.10
99291258--99291362
32
3.3
31
73
17
83
38
13
15
33
1.86
99292586--99292630
19
2.2
22
88
11
69
57
0
0
42
0.98
99293702--99293764
31
2.0
30
85
11
83
28
17
7
46
1.76
99295279--99295330
27
1.9
27
84
0
68
26
25
21
26
1.99
99299195--99299244
23
2.2
24
89
7
77
42
38
8
12
1.71
99300240--99300270
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
99300647--99300677
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
99300664--99300732
21
3.4
20
71
16
70
55
7
1
36
1.37
99303869--99303932
22
2.9
22
77
13
60
62
4
0
32
1.16
99303906--99303937
16
2.1
16
94
5
57
56
6
0
37
1.25
99304164--99304202
10
4.2
10
90
9
57
51
33
0
15
1.44
99303994--99304563
240
2.4
227
89
6
847
52
16
0
30
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99304174--99304565
114
3.4
114
93
1
671
51
16
1
30
1.52
99304471--99304643
99
1.8
94
85
11
248
50
15
0
34
1.44
99304839--99304869
16
1.9
16
93
0
53
0
38
0
61
0.96
99305383--99305412
15
2.0
15
93
0
51
43
3
13
40
1.60
99307056--99307115
31
1.9
30
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12
77
31
11
6
50
1.65
99308324--99308412
30
3.0
30
80
9
101
39
2
17
40
1.63
99308796--99308846
24
2.3
23
83
10
61
54
0
1
43
1.11
99329761--99329802
21
2.0
22
85
4
59
50
2
42
4
1.36
99331382--99331419
20
1.9
20
100
0
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47
7
10
34
1.67
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2.1
28
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6
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41
5
3
50
1.43
99334544--99334723
88
2.0
89
91
4
292
32
23
10
34
1.88
99339214--99339251
19
2.0
19
94
0
67
21
18
15
44
1.86
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4
10.8
4
100
0
86
25
0
23
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1.49
99347146--99347242
33
2.9
33
90
0
149
18
10
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1.84
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18
2.1
18
89
5
56
66
0
0
33
0.92
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19
3.9
19
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5
107
37
16
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34
1.85
99350408--99350446
21
1.9
20
84
5
51
10
5
12
71
1.28
99350639--99350838
45
4.5
45
82
5
226
27
27
12
33
1.93
99350639--99350822
89
2.1
90
83
5
230
28
27
11
32
1.92
99350852--99351145
78
3.8
78
89
2
457
24
23
19
31
1.98
99357314--99357382
21
3.4
21
71
15
72
36
1
7
55
1.37
99357369--99357399
15
2.1
14
94
5
53
35
3
6
54
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99365670--99365702
17
1.9
17
88
11
50
69
0
0
30
0.88
99365670--99365703
18
1.9
17
88
5
50
70
0
0
29
0.87
99365995--99366066
19
3.9
19
85
10
105
36
15
11
37
1.83
99365995--99366057
17
3.5
18
91
4
92
34
14
12
38
1.84
99367868--99367921
26
2.1
26
92
0
90
25
24
12
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1.91
99369902--99369954
13
4.1
13
78
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63
33
9
22
33
1.86
99371340--99371373
18
1.9
18
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5
52
38
2
2
55
1.30
99371544--99371603
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29
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10
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1.69
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107
1.9
107
95
2
364
42
5
9
43
1.59
99375553--99375596
21
2.1
21
95
0
79
29
9
25
36
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325