Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  292  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95403965--95404014
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2.1
21
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2
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.0
264
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2.1
44
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0
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1.8
187
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0
0
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2.2
43
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3
107
26
25
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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1.64
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9
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1.99
95512905--95513211
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12
31
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95544660--95544701
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1.51
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10
8.5
10
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12
57
40
9
3
46
1.54
95559730--95559776
23
2.0
23
87
0
67
25
6
2
65
1.27
95559739--95559783
23
2.0
23
86
0
63
24
11
2
62
1.40
95560487--95560525
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
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3.2
26
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0
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20
19
21
37
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95572544--95572715
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1.8
93
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0
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29
27
21
21
1.99
95572536--95572705
46
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46
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13
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28
20
20
1.98
95576144--95576257
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56
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210
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5
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19
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1.65
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10
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23
1.95
95594463--95594663
108
1.8
110
87
6
302
34
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1.96
95594902--95594932
16
1.9
16
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0
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0
22
35
1.54
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21
2.0
21
100
0
86
34
23
4
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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66
0
0
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0.92
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2.0
25
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42
10
2
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1.49
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13
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0
50
1.24
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2.0
106
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33
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2.0
21
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0
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0
0
68
0.90
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2.0
61
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189
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2
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1.50
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7
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0
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0
0
57
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2.0
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1.57
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2.0
22
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72
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2
33
1.57
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2.1
15
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22
0
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32
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29
1
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1.34
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14
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26
0
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28
2.8
28
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24
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19
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12
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39
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172
36
24
23
14
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28
2.1
28
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0
107
39
20
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36
1.70
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2.7
13
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0
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2
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190
3.0
190
95
2
978
38
14
12
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95703544--95703621
39
2.0
39
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0
120
25
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2.0
37
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89
52
0
0
47
1.00
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1.9
268
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992
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2.2
19
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0
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58
2
2
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24
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0
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24
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0
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1
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2.5
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0
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205
5.7
205
92
0
1879
31
18
21
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325