Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  49  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14758535--14758566
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60
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1.9
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28
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19
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17
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1.96
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7.1
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20
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2.4
132
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1.97
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6.9
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0.83
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24
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3.7
40
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2
188
25
27
21
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
14812472--14812569
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2
2
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20
24
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2.0
64
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7
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33
16
12
38
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
172
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1.96
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0
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3.2
22
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14
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9
22
22
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14896501--14896573
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3.1
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31
0
0.90
14922801--14922827
3
9.0
3
100
0
54
0
33
0
66
0.92
14924759--14924899
25
5.7
24
73
12
97
19
27
18
34
1.95
14924767--14924924
50
3.2
49
76
3
145
21
25
19
32
1.97
14925314--14925422
54
2.0
54
98
0
209
28
14
9
47
1.75
14931974--14932111
27
5.1
27
80
11
167
34
23
23
18
1.96
14931974--14932111
54
2.6
54
90
2
224
34
23
23
18
1.96
14933702--14933809
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
14933892--14933951
30
2.0
30
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0
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20
26
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40
1.89
14938024--14938087
25
2.6
25
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5
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23
25
20
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1.98
14938050--14938131
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1.99
14942531--14942602
28
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28
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4
112
23
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11
48
1.78
14944169--14944203
17
2.1
17
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0
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2
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20
2.0
20
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0
60
35
12
7
43
1.72
14947416--14947457
11
3.8
11
81
9
50
33
0
23
42
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
76
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0
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31
23
20
24
1.98
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25
2.0
25
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0
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22
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28
1.95
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21
2.2
20
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4
52
52
11
20
15
1.74
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12
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12
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21
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12
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1.85
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23
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17
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1.85
14969124--14969169
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2.0
23
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1.82
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2.0
22
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26
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0
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25
1.82
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0
0
52
1.00
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36
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2
0
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1.23
14974609--14974663
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2.1
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0
0
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0
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0
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38
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3.5
12
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58
0
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21
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22
35
24
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1.95
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3.8
50
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179
21
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17
30
1.97
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1.8
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22
29
17
30
1.96
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29
2.2
29
77
13
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33
30
11
25
1.90
14996912--14997171
40
6.5
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299
26
26
20
26
1.99
14996912--14997171
80
3.3
80
85
4
341
26
26
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14996912--14997171
79
3.3
80
86
4
341
26
26
20
26
1.99
15004931--15005063
40
3.3
40
95
2
232
27
27
21
24
1.99
15010185--15010555
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7.5
50
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26
28
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26
1.98
15010181--15010562
146
2.6
146
80
5
367
25
28
18
26
1.98
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2
100
0
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0
0
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1.00
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23
100
0
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30
1.96
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10
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0
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0
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0
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32
1.20
15028157--15028203
19
2.3
22
82
14
64
61
0
4
34
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325