Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  37  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11123272--11123311
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45
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27
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0
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2.4
24
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1
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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0
0
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37
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93
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231
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4
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27
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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19
2.4
18
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13
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0
33
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11191386--11191423
14
2.7
14
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0
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2.0
17
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21
1.9
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85
10
53
15
5
2
77
1.04
11219787--11219836
8
5.7
9
79
11
59
38
0
2
60
1.09
11219799--11219836
17
2.2
17
90
0
58
36
0
0
63
0.95
11220010--11220072
28
2.3
27
81
8
65
31
7
3
57
1.43
11225784--11225851
20
3.1
21
84
16
70
25
2
5
66
1.28
11225780--11225839
10
5.7
10
83
16
61
26
1
5
66
1.21
11244614--11244643
5
6.0
5
92
0
51
80
3
0
16
0.85
11245337--11245405
35
1.9
36
85
8
97
27
1
1
69
1.05
11246126--11246222
41
2.4
41
85
1
124
41
22
19
16
1.90
11246387--11246471
21
3.9
21
75
11
89
27
0
24
48
1.52
11246393--11246484
46
2.0
46
91
0
148
28
0
25
46
1.53
11247062--11247123
23
2.8
22
72
13
63
38
0
6
54
1.26
11248972--11249016
22
2.0
22
100
0
90
42
17
17
22
1.89
11254454--11254519
23
3.1
23
65
24
54
0
30
7
62
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11254454--11254551
45
2.3
42
86
8
128
0
26
9
64
1.23
11261519--11261588
23
3.1
21
69
21
61
0
22
11
65
1.24
11271932--11272078
43
3.4
43
86
0
186
21
21
31
25
1.98
11277505--11277633
46
2.8
46
92
0
213
31
28
20
20
1.97
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30
3.0
30
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9
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15
15
10
1.64
11280012--11280090
15
5.4
15
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8
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59
13
16
10
1.60
11282999--11283126
45
2.8
46
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2
213
29
28
21
21
1.98
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.5
20
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4
0
62
1.14
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1.9
33
100
0
126
39
4
19
36
1.72
11299032--11299106
33
2.3
33
90
0
114
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5
24
34
1.78
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25
2.1
25
85
0
68
38
15
9
36
1.80
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11
2.3
11
100
0
50
64
0
28
8
1.22
11306017--11306066
24
2.1
24
84
0
64
32
24
4
40
1.73
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13
1.9
13
100
0
50
40
0
0
60
0.97
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23
2.0
23
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0
63
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4
6
33
1.46
11315426--11315559
26
5.2
26
94
0
241
37
26
5
30
1.79
11323020--11323094
13
5.7
13
75
20
50
72
4
22
1
1.10
11323038--11323091
26
2.1
26
86
3
74
72
3
22
1
1.10
11327546--11327630
25
3.4
25
72
1
91
32
16
27
23
1.96
11327706--11327764
26
2.4
25
82
5
66
35
23
23
16
1.95
11332515--11332539
12
2.1
12
100
0
50
0
0
8
92
0.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11337098--11337132
13
2.8
12
83
8
52
31
11
0
57
1.34
11337235--11337281
23
2.1
23
84
7
62
31
2
2
63
1.18
11337585--11337638
16
3.4
16
86
0
63
31
25
1
40
1.66
11342327--11342355
2
14.5
2
100
0
58
0
48
0
51
1.00
11343357--11343404
20
2.4
18
78
18
51
64
4
16
14
1.43
11354084--11354523
131
3.4
126
80
7
438
27
15
19
36
1.93
11355950--11356659
133
5.3
133
90
1
1053
29
20
22
26
1.99
11355950--11356659
268
2.7
265
90
2
1080
29
20
22
26
1.99
11356872--11356935
29
2.2
29
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5
76
31
48
1
18
1.58
11357388--11357424
19
2.0
18
94
5
65
32
0
0
67
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325