Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  270  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88510298--88510436
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2.6
53
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3
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20
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1.99
88510298--88510488
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153
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1.98
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2.7
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0
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0
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2.5
125
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365
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1.91
88521546--88521581
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3.2
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63
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25
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1.32
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12
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28
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1.9
142
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1
388
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20
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30
4
2
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2.9
12
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0
61
42
5
0
51
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88550056--88550086
2
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2
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3
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0
0
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1.9
30
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19
33
1.96
88554970--88555001
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2.9
11
95
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21
0
12
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1.25
88573527--88573566
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1.9
21
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0
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25
10
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1.57
88573530--88573680
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2.2
70
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2
223
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10
11
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20
2.5
20
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1
3
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19
1.9
19
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2
5
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1.39
88574000--88574048
19
2.7
18
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9
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40
2
4
53
1.32
88575431--88575500
18
3.8
19
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19
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1
7
45
1.39
88576055--88576150
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2.1
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115
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2
6
29
1.31
88583928--88584109
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3.9
47
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12
180
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28
19
29
1.98
88583889--88584110
46
4.8
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13
146
23
29
19
27
1.98
88586095--88586132
14
2.9
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11
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57
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2.0
30
96
0
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30
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79
2.3
79
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7
215
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26
20
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1.99
88613690--88613874
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4.7
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207
24
27
22
25
2.00
88613657--88613874
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2.7
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200
24
26
22
26
2.00
88621816--88621998
79
2.3
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7
223
24
27
22
24
2.00
88621795--88621998
40
5.1
40
81
8
229
24
27
22
25
2.00
88625459--88625625
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165
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19
28
1.98
88629463--88629592
50
2.6
49
79
6
129
20
26
22
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88643383--88643431
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2.2
21
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42
2
0
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1.11
88643394--88643445
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0
1
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1.06
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2.0
22
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0
0
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2.0
21
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1.50
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2.0
26
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10
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0
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59
1.21
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2.0
22
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0
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0
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0
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1.83
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25
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209
29
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17
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1.98
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2.0
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241
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1.98
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23
1.14
88729885--88729934
20
2.5
21
83
6
68
70
0
8
22
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88739430--88739489
19
3.2
19
81
9
77
33
3
0
63
1.11
88739428--88739489
28
2.2
29
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35
3
0
61
1.12
88739427--88739489
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36
3
0
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1.13
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53
0
0
46
1.00
88752912--88753049
70
2.0
70
100
0
276
29
20
9
40
1.84
88759406--88759450
16
2.9
15
87
9
56
46
0
6
46
1.29
88760500--88760526
11
2.5
11
100
0
54
59
0
11
29
1.32
88776949--88776978
15
2.0
15
93
0
51
56
6
0
36
1.26
88777767--88777803
14
2.6
14
86
0
56
54
2
2
40
1.29
88778804--88778852
24
2.0
24
84
0
62
16
14
40
28
1.87
88782529--88782563
11
3.1
11
87
4
52
34
8
11
45
1.71
88793419--88793686
104
2.6
105
93
1
450
18
20
30
29
1.97
88887332--88887384
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
88888857--88888959
25
4.2
25
93
3
174
36
24
5
33
1.79
88893098--88893149
25
2.0
26
82
10
63
25
15
23
36
1.93
88894629--88894735
26
4.1
26
91
0
178
34
24
8
32
1.85
88897131--88897162
7
4.6
7
92
0
55
43
15
9
31
1.78
88897220--88897537
9
36.6
9
74
8
223
35
0
16
47
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88897206--88897420
48
4.5
48
76
13
205
35
0
15
48
1.49
88897224--88897550
61
5.5
63
75
13
191
35
0
15
47
1.52
88897291--88897527
35
6.7
35
83
7
232
36
1
14
47
1.53
88897375--88897553
34
4.8
35
77
16
166
35
1
14
48
1.51
88897282--88897553
114
2.4
114
87
5
404
36
1
15
47
1.52
88897415--88897541
26
4.8
26
80
5
112
36
1
14
47
1.55
88897439--88897553
44
2.6
44
76
6
133
36
1
13
47
1.54
88898241--88898286
23
2.0
23
95
0
83
41
13
2
43
1.55
88899116--88899160
14
3.5
14
77
22
62
37
4
13
44
1.64
88899117--88899165
24
2.0
24
96
0
89
40
4
10
44
1.57
88902151--88902201
18
2.9
17
77
5
66
25
0
37
37
1.56
88903311--88903356
22
2.1
21
84
11
58
43
32
2
21
1.65
88903453--88903532
38
2.2
38
90
4
128
46
25
2
26
1.65
88903692--88903764
21
3.5
21
72
9
60
24
0
24
50
1.49
88904347--88904402
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
88905816--88905875
30
2.0
30
100
0
120
53
13
16
16
1.73
88907112--88907282
41
4.2
41
75
5
130
22
18
22
36
1.95
88913214--88913312
28
3.4
27
70
20
74
24
28
20
27
1.99
88913214--88913337
60
2.0
60
82
10
146
25
25
20
28
1.99
88917733--88917861
23
5.6
23
74
8
93
34
5
3
56
1.38
88917877--88917943
25
2.9
23
78
10
73
29
5
5
58
1.46
88917888--88917959
25
2.8
25
77
10
67
30
5
4
59
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88917810--88917982
78
2.2
76
79
9
179
31
5
4
58
1.42
88918006--88918061
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
88930564--88931562
71
13.6
74
76
13
772
31
16
18
34
1.93
88930352--88931398
73
14.6
70
74
16
649
31
16
19
33
1.94
88930352--88931424
141
7.5
144
76
15
778
31
16
19
33
1.94
88931418--88931455
14
2.6
15
87
8
60
28
10
5
55
1.56
88931452--88931654
87
2.4
81
84
12
236
31
18
18
32
1.95
88931516--88931735
87
2.6
84
82
9
238
32
16
17
33
1.93
88932447--88932541
30
3.3
30
89
5
144
27
51
6
14
1.66
88933080--88933137
25
2.3
25
82
5
73
36
8
3
51
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325