Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  41  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12239329--12239368
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2.4
17
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0
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65
2
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1.27
12239458--12239567
18
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2
2
32
1.24
12239457--12239576
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18
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62
2
3
31
1.25
12239778--12239829
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20
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1
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1.07
12239773--12239829
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2.7
21
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3
0
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1.12
12239858--12239945
9
9.4
9
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2
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1.17
12239903--12239958
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2.0
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3
69
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1
1
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1.20
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19
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0
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2.1
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0
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2
130
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18
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25
1.98
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244
27
20
26
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1.99
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2.0
45
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0
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89
0
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79
2.0
79
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0
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5.4
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1
214
25
12
28
33
1.92
12296625--12296775
28
5.4
28
91
1
214
25
12
28
33
1.92
12301912--12302084
94
1.8
94
88
2
267
30
19
27
23
1.98
12301912--12302082
46
3.7
46
83
7
211
30
18
28
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12301909--12302115
94
2.2
94
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1
263
29
19
27
23
1.98
12301909--12302115
46
4.4
48
81
3
206
29
19
27
23
1.98
12301912--12302267
46
7.5
49
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11
201
29
20
27
22
1.99
12304397--12304514
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3.5
34
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2
148
34
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12
21
1.91
12311837--12311862
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2.0
13
100
0
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53
15
0
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13
2.2
13
100
0
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55
13
0
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1.39
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20
17
19
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4.0
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10
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14
17
42
1.88
12325268--12325379
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2.2
52
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15
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1.84
12326821--12326926
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2.0
53
100
0
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69
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19
29
1.89
12327892--12327991
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7
101
38
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12338737--12338792
28
2.0
28
83
13
71
41
0
25
33
1.56
12345301--12345333
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2.6
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48
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0
39
1.40
12348228--12348328
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4.5
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104
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0
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16
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12348243--12348326
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14.7
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82
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86
77
1
5
15
1.02
12348268--12348328
16
3.7
16
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79
75
0
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1.01
12353213--12353240
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3.1
9
100
0
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0
0
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1.95
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28
2.0
28
96
0
101
34
32
5
27
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
13
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12
0
39
1.40
12361796--12361906
27
4.1
26
85
7
141
37
23
22
16
1.93
12361796--12361906
54
2.1
54
87
3
161
37
23
22
16
1.93
12366970--12367123
56
2.7
57
88
1
220
27
12
24
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1.92
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3.2
26
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0
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1.81
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5.4
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0
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35
22
22
18
1.95
12375948--12376198
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3.1
80
80
7
247
36
22
21
18
1.95
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0
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0
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1.80
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20
22
27
1.98
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311
29
20
22
27
1.98
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1.9
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12413472--12413580
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24
24
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1.97
12420870--12420919
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2.1
25
85
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56
2
4
38
1.30
12421881--12421971
10
9.0
10
69
17
55
38
4
3
53
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12421911--12421972
32
2.0
30
84
6
79
40
4
3
51
1.39
12423413--12423468
30
1.9
28
82
13
69
46
1
0
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1.11
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75
0
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32
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15
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1.95
12427638--12427701
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2.1
30
82
0
74
32
21
15
29
1.95
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2.0
20
85
5
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47
2
17
32
1.61
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24
2.4
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2
66
20
28
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1.96
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19
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16
27
27
27
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13
2.4
13
94
0
53
16
9
9
64
1.48
12455232--12455607
48
7.9
48
86
2
443
27
31
17
24
1.97
12455232--12455562
95
3.5
95
85
2
448
28
31
16
23
1.97
12455235--12455559
143
2.3
143
87
1
472
28
31
16
24
1.96
12461529--12461890
48
7.6
47
80
2
332
29
29
15
26
1.96
12461529--12461843
95
3.3
95
86
2
418
30
29
14
25
1.95
12461530--12461844
142
2.2
142
85
1
416
30
29
14
25
1.95
12467076--12467113
15
2.6
14
88
12
58
81
2
5
10
0.94
12473414--12473438
11
2.3
11
100
0
50
28
28
0
44
1.55
12474729--12474782
23
2.3
23
90
0
90
25
16
9
48
1.76
12484748--12484793
23
2.0
23
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0
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52
6
0
41
1.27
12491826--12491880
21
2.6
21
85
8
67
34
0
3
61
1.13
12493452--12493480
15
2.0
15
93
6
51
27
3
0
68
1.05
12496287--12496328
22
2.0
21
81
13
50
47
0
9
42
1.36
12496502--12496646
48
3.0
48
100
0
290
40
4
2
53
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12496522--12496647
24
5.2
24
71
21
120
38
4
1
54
1.31
12517121--12517196
20
3.4
24
77
19
67
68
3
1
26
1.15
12517150--12517209
22
2.8
22
82
9
63
68
6
1
23
1.22
12519583--12519724
56
2.5
56
90
4
205
29
16
22
31
1.96
12519815--12520009
97
2.0
97
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0
318
32
6
23
37
1.81
12522543--12522977
216
2.0
216
100
0
870
36
16
12
34
1.87
12523225--12523289
18
3.6
18
85
0
94
43
18
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29
1.81
12523206--12523259
28
1.9
28
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7
65
38
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9
29
1.85
12523223--12523304
36
2.3
36
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0
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1.85
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2.0
13
100
0
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30
30
7
30
1.85
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11
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26
16
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1.40
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19
2.6
19
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3
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54
2
0
44
1.11
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13
3.1
13
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10
55
57
0
2
40
1.12
12525324--12525370
19
2.4
19
76
20
51
36
19
4
40
1.71
12537518--12537592
21
3.4
23
78
12
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40
26
20
13
1.89
12537518--12537604
21
4.0
23
77
10
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25
20
14
1.91
12537976--12538033
15
3.8
15
88
2
89
51
12
0
36
1.39
12539282--12539316
5
7.0
5
100
0
70
60
0
0
40
0.97
12539341--12539366
13
2.0
13
100
0
52
61
0
0
38
0.96
12540283--12540340
17
3.4
17
76
7
64
51
6
3
37
1.46
12541154--12541202
25
2.0
25
87
0
71
38
2
8
51
1.43
12547085--12547117
17
1.9
17
88
11
50
45
33
0
21
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12553486--12553515
14
2.1
14
93
0
51
30
3
26
40
1.72
12574817--12574858
20
2.0
22
86
9
61
35
11
4
47
1.61
12583142--12583180
20
2.0
20
89
0
60
46
15
5
33
1.68
12583471--12583517
19
2.4
20
89
3
69
44
12
4
38
1.62
12585145--12585316
48
3.6
48
80
3
166
21
27
22
28
1.99
12585246--12585346
48
2.1
48
84
0
130
24
27
17
29
1.98
12592709--12592987
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5.8
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13
164
23
27
18
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1.98
12592706--12592940
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2.4
97
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253
23
29
19
28
1.98
12592914--12593025
48
2.3
48
84
6
138
23
24
17
34
1.96
12592946--12593037
48
1.9
48
82
8
116
23
23
18
33
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325