Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  207  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66997572--66997644
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15
122
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1
0
60
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.8
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20
28
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1.98
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2.2
140
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363
28
18
28
24
1.98
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25
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6.5
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389
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25
22
24
2.00
67096372--67096630
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24
2.00
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2.4
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93
1
168
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25
0
30
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.14
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0
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2
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1.20
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2.5
26
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1
1
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1.10
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1.12
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0
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2.3
26
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45
14
14
24
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67141230--67141373
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1.98
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50
0
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16
22
19
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1.91
67153582--67153611
13
2.3
13
94
0
51
50
6
13
30
1.67
67155171--67155205
18
2.0
18
94
5
63
42
0
0
57
0.99
67155178--67155223
18
2.8
17
83
9
51
45
0
0
54
0.99
67155190--67155246
26
2.2
25
81
3
69
40
0
3
56
1.17
67155097--67155282
59
3.1
59
71
11
198
40
1
6
51
1.37
67155293--67155328
18
2.0
18
100
0
72
33
0
0
66
0.92
67155297--67155336
18
2.2
18
86
0
53
42
0
0
57
0.98
67155486--67155580
45
2.1
44
86
1
127
34
27
6
31
1.82
67155559--67155628
16
4.4
16
90
0
113
31
35
1
31
1.67
67162156--67162285
49
2.7
49
78
3
129
22
26
22
28
1.99
67162344--67162469
46
2.8
45
83
11
159
23
26
19
30
1.98
67163084--67163138
27
2.0
27
100
0
110
36
21
10
30
1.88
67164183--67164271
44
2.0
44
97
0
169
37
25
11
25
1.89
67173030--67173090
31
2.0
31
100
0
122
36
22
13
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67176663--67176700
13
2.9
13
96
0
67
10
31
36
21
1.87
67179003--67179118
34
3.4
34
84
0
151
28
8
18
44
1.79
67180329--67180393
31
2.1
31
88
0
94
61
20
4
13
1.50
67180626--67180678
27
2.0
27
88
0
79
7
49
15
28
1.71
67180626--67180688
27
2.4
27
81
2
74
9
46
14
30
1.76
67181090--67181121
13
2.4
14
94
5
57
59
9
0
31
1.29
67183214--67183259
23
2.0
23
91
0
74
39
15
2
43
1.59
67183839--67183904
25
2.6
25
85
0
87
30
16
40
12
1.85
67184015--67184059
14
3.5
14
77
22
62
37
4
13
44
1.64
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24
2.2
24
96
0
99
40
3
9
46
1.54
67187214--67187316
40
2.5
40
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1
134
28
22
14
34
1.93
67188380--67188456
38
2.1
36
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9
111
44
27
2
25
1.67
67188566--67188668
7
14.4
7
69
4
53
23
0
30
46
1.52
67188619--67188667
14
3.4
14
85
2
62
22
0
30
46
1.52
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42
2.8
41
85
4
142
23
20
24
31
1.98
67188949--67189075
41
3.1
41
84
4
150
22
19
22
34
1.96
67190579--67190687
48
2.3
48
88
0
155
36
27
17
18
1.93
67190970--67191005
3
12.0
3
87
0
54
63
2
2
30
1.22
67191643--67191681
16
2.5
15
84
8
51
0
30
7
61
1.24
67193206--67193245
18
2.2
18
86
8
55
30
0
2
67
1.04
67193417--67193499
19
4.0
22
73
11
68
40
8
6
44
1.59
67193748--67193794
23
2.0
23
88
8
69
40
8
0
51
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67195073--67195118
18
2.6
18
92
0
74
15
23
39
21
1.92
67211079--67211107
12
2.5
12
94
5
51
72
0
0
27
0.85
67215894--67215935
17
2.5
17
84
3
59
57
2
4
35
1.33
67215904--67215944
17
2.4
17
88
8
57
60
0
2
36
1.10
67215914--67215954
10
4.2
10
81
15
50
60
2
0
36
1.10
67219195--67219245
17
3.3
17
65
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50
23
5
19
1.69
67219188--67219246
29
2.0
29
100
0
118
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22
1.75
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25
3.5
25
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39
18
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18
1.92
67223846--67223924
25
3.2
24
74
3
59
36
17
22
22
1.95
67229841--67229886
21
2.2
22
88
7
69
21
36
19
21
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325