Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  291  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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23
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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19
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42
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95271125--95271157
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0
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10
6.3
10
75
17
67
64
0
0
35
0.94
95288898--95288952
20
2.9
18
84
12
74
63
0
0
36
0.95
95289709--95289895
104
1.8
104
87
6
283
58
3
1
36
1.23
95289712--95289873
35
4.4
36
71
17
104
56
3
1
38
1.23
95289774--95289846
28
2.6
28
77
14
71
56
1
1
41
1.16
95289809--95289874
19
3.6
20
71
24
56
54
1
3
40
1.25
95289793--95289850
8
6.9
8
74
18
55
55
0
1
43
1.10
95290293--95290356
19
3.3
19
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35
0
3
60
1.12
95290294--95290351
30
1.9
30
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0
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3
62
1.12
95290325--95290383
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0
5
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1.17
95290439--95290480
17
2.3
18
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21
2
2
73
1.06
95290439--95290480
10
4.6
9
82
14
50
21
2
2
73
1.06
95290903--95290948
19
2.3
20
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3
58
47
4
2
45
1.34
95290890--95290957
15
4.4
16
75
14
63
44
5
1
48
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95290938--95290976
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2.9
13
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11
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35
2
0
61
1.10
95292357--95292549
105
1.9
100
82
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244
26
25
15
31
1.96
95292672--95292715
24
1.9
24
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47
13
0
38
1.43
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17
2.0
17
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0
0
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0
0
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95303807--95303837
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0
0
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0
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0
0
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0
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0
0
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47
5
0
47
1.24
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38
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0
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13
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2
0
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0
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2.4
11
100
0
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0
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42
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30
1.9
30
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24
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27
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2.0
49
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0
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14
4
0
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2.4
30
88
2
101
34
1
8
56
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95360834--95360890
23
2.5
22
83
13
71
45
5
12
36
1.64
95361088--95361128
22
1.9
21
85
14
57
75
2
12
9
1.13
95366793--95367057
46
5.7
46
78
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227
22
29
19
28
1.98
95366789--95367059
94
2.9
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347
23
28
19
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1.98
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24
2.5
24
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2
91
37
12
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15
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0
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26
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19
2.1
19
90
0
62
55
0
12
32
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325