Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  70  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21897825--21897932
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2.1
52
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16
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1.99
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2.0
52
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2.0
32
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33
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.82
21965620--21965779
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3.1
52
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23
17
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21975408--21975546
53
2.6
53
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4
237
35
23
23
17
1.95
21977152--21977257
26
4.2
26
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173
34
24
6
33
1.82
21977152--21977257
51
2.1
50
92
5
178
34
24
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1.82
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0
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23
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12
61
28
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0
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2
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5
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0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22037818--22037917
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27
12
1.89
22072256--22072363
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
22072995--22073064
35
2.0
35
100
0
140
31
17
14
37
1.89
22084947--22085002
26
2.2
26
90
6
87
50
14
8
26
1.72
22085010--22085080
20
3.6
20
81
11
76
53
5
0
40
1.24
22085040--22085087
19
2.6
18
84
12
62
50
4
0
45
1.21
22085051--22085087
19
2.0
18
94
5
65
51
5
0
43
1.24
22090320--22090364
22
2.2
20
84
8
54
37
11
2
48
1.51
22095145--22095185
22
2.0
20
86
13
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53
2
9
34
1.47
22099429--22099459
16
1.9
16
93
0
53
70
0
9
19
1.14
22099572--22099616
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13
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14
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73
15
0
11
1.10
22099572--22099629
25
2.3
26
88
8
84
70
13
3
12
1.28
22104973--22105017
19
2.4
19
89
10
67
80
8
6
4
1.03
22105041--22105107
27
2.5
27
100
0
134
16
31
37
14
1.89
22105214--22105262
3
16.7
3
79
12
57
67
0
32
0
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22105213--22105263
18
3.1
16
86
13
68
68
0
31
0
0.90
22105318--22105372
14
3.7
14
76
9
56
65
0
34
0
0.93
22105742--22105780
17
2.3
17
86
0
51
79
2
7
10
1.02
22105830--22106950
141
8.1
133
73
16
439
56
6
7
29
1.53
22105962--22107128
141
8.1
144
77
11
1100
56
6
7
29
1.53
22105817--22107128
296
4.6
290
79
13
1333
56
6
7
29
1.53
22106391--22106432
13
3.2
13
74
12
50
66
2
11
19
1.34
22106516--22106552
13
2.8
13
87
0
56
75
0
2
21
0.92
22106516--22106579
15
4.4
15
75
11
62
70
0
3
26
1.02
22106430--22107128
284
2.4
291
84
9
893
55
6
7
30
1.54
22110286--22110670
49
8.1
49
92
6
614
32
8
31
28
1.86
22110315--22110393
25
3.3
25
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22
69
31
5
31
31
1.79
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72
1.9
72
92
2
237
20
27
20
32
1.97
22119014--22119110
38
2.5
39
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3
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51
12
2
34
1.51
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18
2.3
18
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12
59
0
36
0
63
0.95
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19
2.7
19
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12
59
0
36
0
63
0.95
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19
2.6
18
78
18
55
8
6
8
77
1.12
22122376--22122932
79
7.1
79
91
3
772
32
15
12
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1.84
22122288--22122878
158
3.7
158
88
4
778
32
15
12
39
1.85
22130972--22131016
23
2.0
23
90
0
72
40
4
8
46
1.55
22145162--22145202
21
2.0
21
90
0
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19
29
21
29
1.98
22154784--22154861
41
1.9
41
100
0
156
33
15
14
37
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22157525--22157821
27
11.0
27
82
5
330
40
19
9
30
1.83
22158058--22158140
41
2.0
41
90
0
130
22
19
28
28
1.98
22158629--22158654
11
2.4
11
100
0
52
26
0
19
53
1.45
22161358--22161690
27
12.3
28
76
7
217
40
21
9
29
1.84
22161371--22161581
81
2.6
81
84
4
248
40
21
9
28
1.85
22161931--22162051
41
3.0
41
93
0
206
20
21
30
27
1.98
22162210--22162258
22
2.2
22
85
7
64
22
28
22
26
1.99
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2.4
11
100
0
52
26
0
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1.45
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40
3.5
40
89
3
203
25
28
22
23
1.99
22185856--22185928
27
2.7
27
75
8
67
30
13
16
39
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325