Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  277  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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90614394--90614442
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2.4
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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2.3
50
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23
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1.9
140
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26
1.98
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0
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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1.98
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27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
33
1.07
90787383--90787432
14
3.8
13
82
12
57
76
0
4
20
0.95
90787383--90787414
6
5.2
6
96
3
55
81
0
3
15
0.82
90788724--90789024
88
3.4
87
89
1
440
34
18
17
28
1.94
90788904--90789156
138
1.8
141
85
6
363
34
19
16
29
1.94
90789044--90789263
89
2.6
85
83
8
268
37
18
16
27
1.92
90788814--90789266
225
2.0
227
83
8
575
36
18
17
27
1.93
90791703--90791746
15
2.9
15
80
12
54
29
4
9
56
1.50
90791771--90791826
24
2.3
25
78
9
62
35
5
3
55
1.40
90803318--90803492
55
3.2
55
95
0
323
20
17
10
52
1.74
90804009--90804153
44
3.3
43
72
13
134
35
19
22
22
1.96
90804000--90804165
88
1.9
87
88
3
253
36
19
21
22
1.95
90804538--90804643
43
2.5
42
84
1
122
38
23
17
19
1.93
90806645--90806688
15
2.9
15
80
12
54
29
4
9
56
1.50
90806713--90806768
24
2.3
25
78
9
62
35
5
3
55
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90820633--90820707
26
2.9
26
93
0
123
36
26
5
32
1.79
90826401--90826500
26
3.9
26
93
2
175
39
26
4
31
1.74
90826401--90826500
51
1.9
52
93
2
175
39
26
4
31
1.74
90828797--90828822
10
2.6
10
100
0
52
84
0
0
15
0.62
90839520--90839598
37
2.1
37
88
4
115
25
30
18
25
1.98
90839715--90839952
47
5.1
47
90
1
343
27
30
9
32
1.89
90839715--90839952
93
2.5
93
88
0
341
27
30
9
32
1.89
90845460--90845490
16
1.9
16
93
0
53
25
12
9
51
1.70
90846068--90846179
44
2.5
44
83
8
138
27
25
25
21
1.99
90846463--90846586
44
2.8
43
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6
113
37
20
22
20
1.95
90851001--90851078
31
2.5
31
80
0
93
44
7
11
35
1.69
90856992--90857023
12
2.7
12
100
0
64
31
15
0
53
1.43
90859691--90859786
42
2.2
41
81
13
113
21
19
27
31
1.98
90859691--90859825
43
3.1
43
78
12
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24
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25
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1.97
90862137--90862295
63
2.5
63
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6
169
25
7
33
33
1.84
90868493--90868529
9
4.1
9
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13
58
45
10
10
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1.74
90868885--90868914
16
1.9
16
93
6
53
26
26
0
46
1.53
90869024--90869104
17
4.6
17
73
20
78
39
2
1
56
1.20
90874742--90874772
13
2.4
13
100
0
62
80
0
0
19
0.71
90885324--90885382
19
3.1
18
78
11
64
38
6
16
37
1.76
90885840--90885977
45
3.1
44
88
2
204
18
20
21
40
1.91
90891120--90891274
43
3.6
43
94
1
267
30
31
25
12
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90891272--90891359
38
2.3
38
94
0
149
30
25
21
22
1.99
90891336--90891382
23
2.0
23
100
0
94
34
21
14
29
1.93
90891298--90891420
61
2.0
61
98
0
237
31
24
19
24
1.98
90891359--90891460
38
2.7
38
90
3
152
32
23
19
24
1.98
90891272--90891451
99
1.8
99
92
0
306
31
23
20
23
1.98
90903433--90903462
14
2.1
14
93
0
51
30
13
16
40
1.87
90905579--90905614
17
2.0
18
89
10
56
0
27
0
72
0.85
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1.9
25
86
0
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2
27
2
68
1.11
90905588--90905635
21
2.3
21
82
13
55
2
27
2
68
1.11
90905645--90905691
25
1.9
24
83
12
60
12
10
2
74
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325