Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  307  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.81
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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16
3.1
17
74
20
51
76
1
10
10
1.10
99903146--99903199
21
2.5
20
75
21
56
70
5
0
24
1.08
99903161--99903199
21
1.9
19
90
10
60
76
0
0
23
0.78
99904831--99904967
60
2.3
59
81
8
143
26
23
20
29
1.99
99910658--99912857
550
4.0
550
97
0
4071
25
19
19
35
1.95
99913532--99913632
50
2.0
50
100
0
202
9
32
13
43
1.78
99916508--99916550
21
2.1
21
86
4
61
48
16
11
23
1.78
99917402--99917440
21
1.9
20
84
5
51
35
0
2
61
1.10
99920819--99920866
19
2.5
19
83
10
62
45
4
2
47
1.33
99920854--99920924
30
2.4
30
80
17
85
57
1
0
40
1.07
99920893--99920930
20
1.9
20
100
0
76
52
0
0
47
1.00
99926444--99926493
19
2.8
18
77
19
59
40
48
2
10
1.48
99927673--99927712
16
2.6
16
92
4
64
35
0
0
65
0.93
99927736--99927829
3
30.3
3
69
18
50
31
5
3
59
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99927736--99927770
13
2.8
13
86
4
54
28
5
2
62
1.32
99927738--99927774
19
1.9
19
94
0
65
27
5
5
62
1.39
99927780--99927833
21
2.6
21
82
11
74
37
3
0
59
1.15
99932899--99932928
13
2.4
13
94
5
53
76
0
23
0
0.78
99934551--99934680
65
2.0
66
87
3
192
31
18
13
36
1.90
99935214--99935310
45
2.2
46
83
7
119
31
17
22
27
1.97
99934817--99936083
177
7.2
176
88
2
1756
30
18
22
29
1.97
99935923--99935987
34
1.9
34
81
6
78
35
20
18
26
1.95
99939278--99939311
13
2.6
13
100
0
68
47
5
0
47
1.26
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2.8
37
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7
133
33
3
2
60
1.30
99940923--99940996
16
4.2
17
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71
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1
1
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1.10
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27
1.9
27
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11
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26
9
3
60
1.45
99941187--99941221
15
2.3
15
100
0
70
40
0
5
54
1.24
99941188--99941238
19
2.6
18
79
14
57
37
0
7
54
1.29
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20
2.0
20
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9
57
31
0
4
63
1.15
99947334--99947376
5
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5
100
0
86
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0
0
18
0.69
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5
5.6
5
100
0
56
82
0
0
17
0.68
99952133--99952159
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
99952519--99952580
3
20.7
3
100
0
124
32
0
0
67
0.91
99952850--99952925
28
2.7
27
74
11
66
63
2
1
32
1.17
99957824--99957891
31
2.2
30
84
2
82
38
7
13
41
1.72
99960070--99960188
10
12.4
10
69
20
60
58
2
3
35
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99960805--99960836
11
2.9
11
100
0
64
43
18
0
37
1.51
99960969--99961080
48
2.3
47
85
11
147
36
9
4
49
1.56
99960969--99961103
48
2.8
45
81
14
146
32
9
5
51
1.59
99962639--99962682
18
2.4
18
84
0
61
18
27
9
45
1.79
99966177--99966684
126
4.0
125
93
1
827
27
19
18
34
1.95
99966983--99967055
20
3.8
20
69
20
64
45
19
0
35
1.51
99975773--99975807
18
1.9
18
88
0
52
57
5
0
37
1.23
99976051--99976291
127
1.9
128
84
2
326
39
14
10
35
1.81
99977362--99977445
34
2.4
34
98
2
159
27
8
16
47
1.75
99985790--99985890
30
3.4
30
91
0
157
27
47
3
20
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325