Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  121  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38825580--38825663
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3.1
27
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5.6
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331
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1.99
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25
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33
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1.82
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1.85
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134
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1.94
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2.2
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20
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20
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2.6
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1
144
18
18
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1.83
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48
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19
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23
1.98
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0
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26
20
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1.98
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2.2
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30
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1.97
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1.86
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1.9
25
86
0
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37
14
10
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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28
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1.86
38898339--38898884
190
2.9
190
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1
956
33
8
28
29
1.86
38900345--38900449
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2.6
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158
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1.98
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1.8
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317
27
29
21
20
1.98
38909323--38909498
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12
216
28
29
21
20
1.98
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4.0
40
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1.98
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1.9
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16
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29
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19
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4
11
46
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39
2.0
39
97
0
145
37
5
11
45
1.63
38919766--38919828
20
3.2
20
69
13
67
41
4
12
41
1.64
38919766--38919857
39
2.4
38
89
7
132
39
5
10
44
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38925052--38925104
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2.0
27
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26
15
30
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2.1
85
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0
349
37
7
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26
1.84
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2.3
82
84
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234
24
22
27
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2.00
38929382--38929566
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4.7
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234
23
22
28
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1.99
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79
2.0
79
84
7
208
25
20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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232
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22
27
25
2.00
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4.6
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216
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22
28
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2.00
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2.0
79
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208
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21
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52
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29
1.85
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6.5
40
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306
25
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1.85
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1.85
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3.6
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1.84
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1.60
39012087--39012163
15
5.2
15
80
9
79
57
14
16
11
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39013516--39013542
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2.1
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0.62
39017914--39017948
18
1.9
18
88
11
54
57
0
20
22
1.41
39020014--39020071
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
39020014--39020074
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
39025019--39025071
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
39029878--39029912
18
1.9
18
88
11
54
22
20
0
57
1.41
39030835--39030882
19
2.5
19
83
10
53
8
10
2
79
1.02
39035534--39035617
30
2.8
30
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7
80
25
19
27
28
1.98
39037885--39037915
16
1.9
16
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0
53
6
12
0
80
0.89
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15
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15
83
2
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3
15
1
79
0.95
39037884--39037943
21
2.8
21
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2
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3
15
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0.93
39040050--39040091
18
2.2
20
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8
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71
7
7
14
1.29
39046481--39046523
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12
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12
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11
6
6
74
1.21
39046465--39046541
40
1.9
41
83
2
102
14
7
6
71
1.29
39046465--39046543
41
1.9
41
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5
106
13
7
7
70
1.31
39049129--39049226
30
3.3
30
72
4
90
27
26
16
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39051838--39051901
5
12.6
5
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78
4
15
1
1.00
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21
3.2
21
78
15
70
77
4
16
1
0.99
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11
5.1
11
70
17
51
77
3
16
1
1.00
39051856--39051901
16
3.1
14
82
14
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76
4
17
2
1.06
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2.1
12
100
0
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0
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1.02
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1
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1.33
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30
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27
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1.97
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0
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0
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0
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1.54
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2.2
20
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10
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100
0
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0
14
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10
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15
3
3
78
0.99
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3.5
16
85
10
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13
3
3
79
1.01
39069001--39069066
30
2.2
30
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100
15
3
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0.99
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1.9
22
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0
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26
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1.77
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2.1
19
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0
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25
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1.95
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23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
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1.25
39085113--39085150
16
2.3
16
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4
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5
18
0
76
0.97
39087460--39087494
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2.6
13
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82
0
0
17
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9
2.9
9
100
0
52
88
0
0
11
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39090924--39091005
40
2.0
41
97
2
157
25
23
21
29
1.99
39095013--39095095
41
2.0
41
100
0
166
25
24
21
28
1.99
39100299--39100333
18
1.9
18
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22
20
0
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0
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3.3
30
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0
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64
0
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100
0
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5
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3
19
1
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1.02
39126607--39126666
11
5.7
11
74
14
56
3
18
1
76
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325