Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  251  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81910157--81910228
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1.9
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11.1
40
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20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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26
1.99
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2.0
25
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1.86
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2
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29
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1011
32
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29
1.86
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2.0
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2.0
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132
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0
0
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0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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58
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17
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.94
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36
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14
26
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19
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2.0
30
93
0
102
45
13
13
28
1.81
82083034--82083076
18
2.3
19
80
4
52
44
11
11
32
1.77
82083214--82083255
21
2.0
21
85
0
57
50
4
21
23
1.68
82094425--82094546
43
2.8
44
83
2
156
40
11
16
31
1.84
82098281--82098311
8
3.8
8
95
4
53
74
0
0
25
0.82
82099245--82099418
30
5.8
30
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1
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25
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3
22
1.66
82099245--82099418
59
2.9
59
96
1
312
25
48
3
22
1.66
82099245--82099418
89
1.9
90
90
1
278
25
48
3
22
1.66
82099989--82100047
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0
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3
0
61
1.13
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2.5
24
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1.59
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34
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1.57
82100109--82100164
20
2.9
19
77
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5
5
57
1.44
82100122--82100164
22
2.0
21
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13
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4
4
60
1.37
82100275--82100322
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
82100275--82100326
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82108819--82109155
76
4.5
73
87
4
435
32
15
19
32
1.94
82108805--82109156
148
2.4
148
83
7
462
31
15
19
33
1.93
82109303--82109449
72
2.0
73
90
1
233
21
15
23
38
1.92
82109461--82109671
71
3.0
68
86
10
293
29
16
21
32
1.95
82109299--82109590
156
1.8
159
86
5
432
27
15
22
34
1.94
82109653--82109681
12
2.3
13
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5
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13
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1.37
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228
2.2
226
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1.95
82109595--82109753
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1.8
85
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25
17
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35
1.95
82109666--82109801
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1.9
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28
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1.97
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2.2
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436
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17
21
34
1.95
82110577--82110730
30
5.3
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20
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24
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5
25
1.74
82110570--82110731
58
2.8
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16
179
24
45
5
24
1.75
82110939--82110968
15
2.1
14
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6
51
30
0
20
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1.49
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2.5
27
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2
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1
0
64
1.02
82111288--82111352
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4.7
14
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35
1
0
63
1.04
82111575--82111617
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6.4
7
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10
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2
0
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1.06
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25
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29
2
1
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1.08
82119356--82119395
17
2.3
17
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53
77
5
0
17
0.94
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2.2
21
88
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44
0
0
55
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3.0
36
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127
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20
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1.98
82130103--82130375
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26
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1.84
82130345--82130465
45
2.7
46
82
8
149
24
26
11
37
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82134386--82134416
16
2.0
15
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29
32
25
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1.93
82134472--82134858
77
5.0
79
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480
27
25
20
26
1.99
82134444--82134858
39
10.7
39
79
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27
26
20
25
1.99
82136098--82136204
37
2.9
38
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148
27
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1.97
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49
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29
26
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1.85
82136353--82136612
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95
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12
275
29
25
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82136550--82136719
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27
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2.00
82151235--82151419
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40
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234
25
27
22
24
2.00
82154053--82154156
26
4.0
26
92
0
172
35
23
7
33
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325