Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A03 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  19  of  325  ( 38900 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6086075--6086100
13
2.0
13
100
0
52
30
0
15
53
1.42
6098073--6098122
16
3.2
16
72
13
50
48
2
2
48
1.24
6104748--6104788
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
6109835--6109884
12
4.2
12
71
19
50
26
32
34
8
1.85
6109847--6109905
24
2.5
24
91
0
91
27
30
35
6
1.83
6113406--6113457
24
2.2
24
85
0
68
53
9
3
32
1.51
6119790--6119816
11
2.5
11
100
0
54
7
25
37
29
1.83
6131115--6131145
2
15.5
2
93
0
53
0
45
0
54
0.99
6133825--6133864
21
2.0
20
90
5
62
35
0
22
42
1.54
6133830--6133872
21
2.1
21
83
12
54
32
2
20
44
1.65
6146059--6146114
6
9.3
6
100
0
112
83
0
0
16
0.64
6146049--6146121
6
11.3
7
91
7
63
82
0
2
15
0.79
6158335--6158368
16
2.1
17
88
5
52
29
23
5
41
1.78
6163714--6163766
18
2.9
18
91
0
88
32
26
15
26
1.95
6165412--6165445
16
2.1
17
88
5
52
29
23
5
41
1.78
6167778--6167972
38
5.1
38
91
0
309
32
24
21
21
1.98
6172484--6172585
39
2.6
39
93
0
177
40
25
5
28
1.79
6175721--6175873
76
2.0
77
89
3
238
38
17
24
19
1.93
6196813--6196864
27
2.0
27
84
3
70
34
5
5
53
1.49
6196844--6196887
23
2.0
22
81
4
52
36
4
2
56
1.32
6196909--6196967
29
2.0
30
90
6
95
30
5
0
64
1.15
6196866--6196963
25
3.8
25
72
15
81
29
7
3
60
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6196917--6196973
14
4.0
14
74
19
55
26
8
0
64
1.22
6197635--6197883
130
1.9
127
87
4
365
28
17
17
35
1.93
6201553--6201634
43
1.9
43
84
0
110
35
20
4
39
1.74
6204179--6204784
45
13.7
45
66
9
163
28
19
24
27
1.99
6204179--6204862
132
5.2
132
89
0
1037
27
19
24
28
1.99
6204984--6205134
44
3.5
43
77
8
162
29
15
26
28
1.96
6204947--6205132
89
2.1
87
88
2
282
30
16
25
27
1.97
6204718--6205271
45
12.5
44
70
11
238
30
18
22
28
1.97
6204947--6205182
89
2.7
88
83
6
270
31
16
23
27
1.96
6207230--6207281
27
2.0
27
84
3
70
34
5
5
53
1.49
6207261--6207304
23
2.0
22
81
4
52
36
4
2
56
1.32
6207326--6207377
27
1.9
27
92
7
88
30
5
0
63
1.18
6207283--6207379
25
3.8
25
74
12
88
29
7
3
59
1.39
6207334--6207383
14
3.6
14
71
17
50
28
6
0
66
1.15
6207925--6208276
129
2.8
129
80
6
378
26
17
17
38
1.91
6208874--6209000
19
6.9
19
87
10
185
37
10
14
37
1.81
6208895--6208950
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83
6208874--6209007
54
2.5
55
90
7
204
37
9
15
37
1.81
6208902--6208987
17
5.0
15
84
13
73
38
8
13
39
1.75
6208874--6209000
36
3.5
37
86
10
174
37
10
14
37
1.81
6208979--6209023
23
2.0
23
86
4
65
35
6
20
37
1.79
6208925--6209026
19
5.2
21
81
11
78
36
6
17
39
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6209291--6209326
18
1.9
19
88
5
56
30
0
0
69
0.89
6210515--6210563
22
2.2
23
82
10
57
16
10
10
63
1.52
6213100--6213139
20
2.0
20
90
9
64
22
5
2
70
1.19
6217864--6217889
12
2.2
12
100
0
52
92
0
7
0
0.39
6218498--6218556
10
6.0
10
84
11
68
25
6
1
66
1.26
6239959--6240049
44
2.1
44
91
0
146
29
12
9
48
1.73
6243702--6243763
28
2.3
27
78
13
74
46
9
20
22
1.80
6246281--6246702
4
106.0
4
97
0
767
25
0
25
49
1.50
6247634--6247674
17
2.4
18
80
15
52
78
0
4
17
0.93
6249268--6249329
18
3.4
18
72
16
56
74
4
6
14
1.19
6249301--6249343
23
1.9
23
85
4
61
74
2
6
16
1.14
6265610--6265644
16
2.2
16
89
0
52
80
0
2
17
0.84
6274710--6274750
19
2.2
19
100
0
82
29
14
14
41
1.86
6281066--6281129
31
2.1
31
93
0
110
32
17
42
7
1.78
6285317--6285365
26
1.9
26
87
4
73
30
16
10
42
1.81
6289720--6289750
16
1.9
16
100
0
62
58
0
25
16
1.38
6291741--6291863
26
5.0
26
65
16
73
19
20
20
39
1.92
6296085--6296129
22
2.0
22
100
0
90
20
22
13
44
1.85
6307819--6307853
19
1.9
18
88
11
54
17
8
28
45
1.77
6311561--6311836
48
5.8
48
78
3
268
28
21
27
22
1.99
6311574--6311845
96
2.8
96
83
1
330
29
20
27
22
1.99
6311560--6311824
144
1.8
144
83
1
352
29
21
27
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6313308--6313417
55
2.0
55
90
0
175
37
12
11
38
1.80
6316752--6316792
17
2.5
17
92
4
66
24
12
19
43
1.85
6331246--6331275
12
2.6
12
94
5
53
60
6
6
26
1.47
6331744--6331791
25
2.0
24
84
12
62
31
0
2
66
1.03
6333247--6333292
17
2.7
17
82
0
65
47
17
0
34
1.48
6333224--6333292
34
2.0
34
86
5
95
47
14
4
33
1.64
6333694--6333737
14
3.1
14
90
6
70
38
22
4
34
1.75
6334073--6334170
34
2.9
34
81
6
101
25
23
25
25
2.00
6334070--6334200
17
7.6
17
71
5
75
23
21
29
25
1.99
6334161--6334209
18
2.7
19
84
9
66
22
14
34
28
1.93
6334476--6334583
22
4.8
22
81
10
128
37
22
8
32
1.84
6334641--6334687
18
2.6
18
100
0
94
31
10
25
31
1.90
6343628--6343668
16
2.6
16
82
17
50
78
2
0
19
0.87
6345669--6345693
13
1.9
13
100
0
50
0
0
24
76
0.80
6349627--6349690
25
2.6
25
77
7
67
29
18
29
21
1.97
6359825--6359878
27
2.0
27
89
3
83
27
16
1
53
1.53
6360149--6360202
27
2.0
27
88
3
81
55
0
0
44
0.99
6360209--6360253
19
2.4
19
85
14
58
66
4
0
28
1.11
6360018--6360499
233
2.0
241
83
9
610
48
4
5
41
1.47
6360408--6360499
20
4.4
21
68
21
59
64
1
1
33
1.08
6360566--6360632
28
2.3
30
82
14
79
40
0
1
58
1.07
6360597--6360644
20
2.5
20
82
3
53
35
0
4
60
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6360594--6360635
20
2.1
20
90
0
66
38
0
0
61
0.96
6360724--6360760
19
1.9
19
94
0
65
24
2
0
72
0.97
6360709--6360779
35
1.9
36
83
8
90
30
2
2
63
1.23
6363602--6363637
18
2.0
18
100
0
72
27
22
5
44
1.75
6367820--6368086
48
5.6
48
80
1
268
25
17
31
25
1.97
6367755--6368086
96
3.5
96
81
3
339
26
17
29
26
1.97
6370066--6370135
35
2.0
35
100
0
140
40
17
17
25
1.90
6370167--6370238
28
2.5
29
81
2
83
59
8
13
18
1.58
6370269--6370311
17
2.6
17
79
17
54
9
6
2
81
0.95
6371613--6371750
68
2.0
68
98
0
267
24
34
12
28
1.92
6373141--6373168
7
4.0
7
100
0
56
28
0
0
71
0.86
6375766--6375812
24
1.9
25
82
4
60
12
17
4
65
1.40
6375975--6376029
19
3.3
19
63
36
54
56
10
0
32
1.34
6375974--6376035
30
2.1
30
100
0
124
58
9
0
32
1.31
6378769--6378929
44
3.5
44
83
11
214
29
21
15
33
1.94
6386562--6386646
37
2.3
37
95
0
152
32
22
15
29
1.94
6386633--6386672
7
5.7
7
90
0
53
25
27
7
40
1.82
6386599--6386711
58
1.9
58
94
0
199
28
23
15
32
1.95
6392721--6392791
29
2.4
30
76
6
74
43
7
7
42
1.59
6393286--6393347
30
2.1
30
87
0
88
59
11
3
25
1.46
6393385--6393434
22
2.3
22
79
6
57
58
2
18
22
1.49
6395886--6395929
23
1.9
23
86
9
63
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6395886--6395924
19
2.0
19
90
5
60
46
0
0
53
1.00
6397433--6397662
116
2.0
116
97
0
433
36
12
18
32
1.88
6397866--6397904
20
1.9
21
84
5
53
64
2
10
23
1.37
6397818--6398117
3
99.3
3
72
10
184
62
2
8
27
1.35
6398495--6398533
20
1.9
21
84
5
53
64
2
10
23
1.37
6398567--6398730
29
5.6
28
74
14
129
63
1
7
27
1.31
6398440--6398730
16
17.8
16
68
11
110
62
2
7
26
1.35
6398438--6398740
3
100.3
3
71
10
172
62
2
8
27
1.36
6399060--6399370
3
102.3
3
73
9
220
63
1
7
27
1.32
6399591--6399629
21
1.9
21
89
5
62
69
7
0
23
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325