Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  59  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18057607--18057724
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40
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0
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1.27
18060180--18060237
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20
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0
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65
1
6
25
1.27
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13
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4
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2.0
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2.6
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4
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24
2.4
24
81
0
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1
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1.25
18071594--18071670
23
3.2
23
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21
77
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1
3
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1.25
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1.26
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1000
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17
31
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1.96
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2.5
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2.4
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2.7
12
95
0
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40
0
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50
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18086407--18086445
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3.2
23
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1
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1.20
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8
5.9
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1.15
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23
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1.30
18086503--18086573
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1
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57
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18086528--18086559
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42
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32
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30
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2.0
18
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58
0
2
38
1.13
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2.0
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2.1
21
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0
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2.0
23
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10
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18114773--18114817
23
2.0
23
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8
56
40
13
8
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18122517--18122562
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2.0
23
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10
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36
1.65
18122524--18122568
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
18126053--18126082
12
2.4
12
94
5
51
40
13
0
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1990
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1.87
18135918--18136970
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3.0
348
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1998
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12
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1.87
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120
15
20
18
46
1.85
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2.8
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18
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1.92
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0
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1.61
18171653--18171708
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1.90
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42
2.7
42
79
5
131
44
16
21
16
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18179256--18179308
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2.0
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0
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52
13
13
20
1.73
18179383--18179429
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2.0
24
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0
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1.74
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0
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1.32
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17
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1
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1.96
18192697--18192743
3
15.7
3
89
8
69
34
0
2
63
1.06
18192821--18192879
25
2.5
24
81
13
68
45
8
11
33
1.71
18195200--18195365
45
3.6
45
76
12
181
32
18
19
29
1.96
18195196--18195395
96
2.1
96
92
1
330
35
18
18
28
1.95
18195150--18195673
286
1.8
286
78
4
590
33
16
20
29
1.94
18203984--18204050
29
2.3
29
84
0
80
28
11
25
34
1.91
18208278--18208312
11
3.2
11
91
0
52
20
34
14
31
1.92
18219249--18219416
48
3.5
48
89
0
255
26
19
27
26
1.99
18219394--18219439
23
2.0
23
100
0
92
17
13
34
34
1.88
18219300--18219524
119
1.9
119
89
1
353
24
18
29
27
1.98
18219346--18219488
71
2.0
71
91
0
232
21
16
31
30
1.96
18219417--18219525
48
2.3
48
91
0
173
22
17
32
28
1.96
18222941--18223137
39
5.0
39
86
1
241
45
20
3
30
1.66
18222941--18223140
78
2.5
78
86
3
267
45
21
3
30
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18225932--18226036
51
2.1
51
98
0
201
20
17
17
45
1.85
18232264--18232468
27
7.6
27
85
4
252
29
28
15
26
1.96
18234584--18234637
5
9.7
6
73
15
53
48
1
0
50
1.11
18234587--18234650
33
1.9
33
84
6
85
50
4
0
45
1.22
18235884--18235916
11
2.8
12
86
4
50
48
12
3
36
1.56
18246481--18246523
22
1.9
22
85
4
59
62
0
6
30
1.21
18249254--18249294
17
2.5
17
84
11
50
41
7
4
46
1.53
18251982--18252055
12
5.7
12
76
17
76
24
0
14
60
1.34
18251978--18252061
27
3.1
27
98
0
159
28
0
14
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1.38
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28
2.0
28
100
0
112
35
14
10
39
1.81
18260720--18260766
23
2.0
23
100
0
94
38
21
17
23
1.93
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40
2.5
38
80
8
117
16
23
28
30
1.96
18264026--18264062
13
2.8
13
91
4
56
27
0
21
51
1.48
18264601--18264645
20
2.2
21
84
11
67
20
31
28
20
1.97
18268109--18268165
15
3.8
15
78
0
69
28
54
7
10
1.60
18268106--18268172
15
4.1
18
69
21
56
28
53
7
10
1.62
18270658--18270698
19
2.0
21
86
9
59
56
2
0
41
1.13
18273108--18273229
29
4.2
29
68
10
88
26
6
0
66
1.21
18273109--18273219
14
7.6
14
73
17
68
27
7
0
64
1.25
18273184--18273229
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15
18273108--18273235
58
2.2
57
79
8
134
25
7
0
66
1.22
18274757--18274797
4
10.5
4
84
5
57
70
0
4
24
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18277580--18277612
17
2.0
17
88
5
50
51
9
12
27
1.69
18279414--18279453
20
2.0
20
100
0
80
30
15
10
45
1.78
18286333--18286501
58
2.9
58
95
0
295
28
29
19
22
1.98
18286340--18286498
29
5.5
29
71
12
121
28
28
20
22
1.98
18286667--18286962
43
6.9
43
87
1
441
32
32
22
11
1.91
18293100--18293140
21
2.0
21
85
4
57
12
29
24
34
1.91
18306953--18307019
33
2.0
33
88
5
100
43
1
14
40
1.55
18310273--18310300
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
18320254--18320304
25
2.1
24
88
3
75
17
21
21
39
1.93
18321333--18321404
5
14.2
5
87
12
103
40
0
0
59
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325