Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  312  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100979753--100979784
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0
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1
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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101039688--101039916
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280
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1.73
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0
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1
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1.22
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2.0
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2.1
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0
2
43
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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202
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0
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14
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10
67
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101122988--101123144
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1.38
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3.0
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4
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17
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19
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16
52
30
28
0
40
1.57
101134418--101134458
21
2.0
21
90
9
66
41
24
12
21
1.87
101134906--101134941
18
2.1
18
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5
56
33
25
0
41
1.55
101135918--101135998
3
27.0
3
71
14
60
59
1
1
38
1.13
101137515--101137571
23
2.5
23
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0
69
22
31
12
33
1.91
101138063--101138098
19
1.9
19
88
5
56
52
0
0
47
1.00
101139473--101139512
17
2.4
17
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0
53
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2
10
30
1.45
101139663--101139716
30
2.0
28
82
17
69
57
9
3
29
1.47
101140939--101140971
17
1.9
17
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50
15
9
42
33
1.78
101142218--101142254
18
2.1
18
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0
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0
24
24
1.49
101142218--101142254
12
3.1
12
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0
56
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0
24
24
1.49
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2.0
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15
1.92
101148734--101148781
20
2.5
20
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3
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62
2
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1.35
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11
2.3
11
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0
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0
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30
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27
3
47
21
1.65
101151112--101151288
54
3.3
54
93
0
282
27
5
46
21
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101151274--101151360
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4.8
18
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0
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3
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17
1.64
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20
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20
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21
1.37
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2.2
24
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0
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37
3
1
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1.27
101153493--101153533
21
2.0
21
85
9
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7
0
36
1.27
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2.1
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0
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0
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2.5
19
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2
6
27
1.28
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19
2.7
19
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64
1
5
28
1.27
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14
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0
0
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0.92
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3.1
16
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0
1
28
0.99
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18
2.1
17
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56
37
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10
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1.62
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2.0
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162
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1.78
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20
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1.97
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93
1.8
93
93
0
299
20
20
29
29
1.98
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24
2.8
24
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0
114
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24
18
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1.80
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3
12.3
3
94
0
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32
5
0
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1.18
101175882--101175927
12
3.8
12
79
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39
0
4
56
1.19
101175980--101176029
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2.3
21
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22
6
26
46
1.74
101176391--101176420
3
10.3
3
92
7
53
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101176794--101176819
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0
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0
0
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0.93
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21
2.0
21
90
0
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4
23
48
1.69
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42
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2
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32
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1.93
101177238--101177368
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2.0
64
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0
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0
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0
0
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0.93
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22
8
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1.78
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2.2
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6
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4.9
19
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36
10
16
36
1.84
101180865--101180920
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325