Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  285  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93204147--93204183
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19
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1.97
93226029--93226178
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3.4
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20
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3
182
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19
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1.97
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24
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10
37
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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94
0
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0
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34
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
93337256--93337293
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46
5.6
46
84
7
277
20
23
14
41
1.88
93349397--93349677
96
3.0
96
91
3
428
20
23
13
41
1.88
93349445--93349677
46
5.0
46
87
6
324
21
24
13
40
1.89
93351739--93351778
17
2.4
16
87
4
53
0
32
0
67
0.91
93351807--93351852
16
2.8
17
83
6
58
13
13
0
73
1.09
93351803--93351840
10
3.7
10
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13
51
5
15
0
78
0.91
93360807--93360848
19
2.2
19
87
8
59
28
0
9
61
1.27
93364324--93364350
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
93368423--93368462
20
2.0
21
85
5
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20
22
17
40
1.92
93368522--93368586
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12
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23
40
1.89
93368504--93368604
39
2.6
39
95
0
175
12
25
24
36
1.91
93370277--93370324
24
2.0
25
95
4
89
52
8
2
37
1.44
93370277--93370334
27
2.2
26
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11
84
50
8
3
37
1.50
93378670--93378700
14
2.1
15
94
5
55
45
6
6
41
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93395231--93395272
19
2.3
18
87
4
57
69
2
2
26
1.13
93395636--93395715
22
3.6
22
86
8
110
10
0
55
35
1.34
93395654--93395713
13
5.2
13
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29
55
6
0
55
38
1.27
93395654--93395719
22
3.0
22
97
0
123
7
0
56
36
1.28
93395794--93395838
15
2.9
15
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3
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6
4
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51
1.49
93396209--93397292
206
5.3
206
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0
1900
28
22
18
29
1.98
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23
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10
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2
8
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1.40
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2.5
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0
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15
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0
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9
0
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1.34
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15
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6
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2.0
29
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0
89
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29
1.85
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2.5
27
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77
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4
4
31
1.37
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43
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24
1.99
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2.4
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22
20
29
1.99
93420289--93420413
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2.8
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146
28
27
16
28
1.97
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21
2.1
21
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0
52
54
6
6
31
1.53
93432608--93432676
27
2.5
27
77
11
77
59
4
4
31
1.37
93439783--93439812
14
2.1
14
100
0
60
43
36
0
20
1.52
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11
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90
9
50
0
12
0
87
0.54
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2.1
22
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47
2
0
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16
2.1
16
89
5
52
34
2
5
57
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93463222--93463260
2
19.5
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0
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2
0
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1.14
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52
54
0
2
43
1.12
93469484--93469527
22
2.0
21
83
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2
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93471135--93471177
21
2.0
21
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0
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22
2.3
22
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0
75
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0
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2.0
22
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7
26
0
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43
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1.95
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82
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218
25
16
22
35
1.94
93478457--93478499
22
2.0
22
86
4
61
53
6
0
39
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325