Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  30  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9021655--9021803
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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137
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2.2
24
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16
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21
1
7
69
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9181081--9181135
12
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0
279
28
17
27
26
1.98
9219557--9219719
43
3.8
43
75
6
159
27
15
25
31
1.96
9219787--9219836
25
2.0
25
96
0
91
48
10
24
18
1.78
9224197--9224259
27
2.4
27
84
7
76
20
20
22
36
1.95
9224316--9224361
23
2.0
23
86
0
65
15
17
23
43
1.87
9224194--9224475
25
11.5
24
67
17
98
18
19
21
40
1.92
9224423--9224475
24
2.3
23
86
3
70
16
22
24
35
1.95
9226008--9226152
50
2.9
50
90
1
211
28
28
17
26
1.97
9230627--9230818
50
3.8
50
88
2
271
20
29
23
26
1.99
9230912--9230942
13
2.4
13
94
0
53
54
12
0
32
1.38
9231153--9231210
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
9238149--9238347
51
3.8
51
82
6
231
21
28
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9238442--9238473
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
9238685--9238742
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
9245737--9245918
102
1.8
100
90
2
292
20
29
23
26
1.99
9245737--9245930
50
3.8
50
88
2
280
20
29
23
27
1.98
9246024--9246055
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
9246270--9246327
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
9247455--9247481
12
2.2
12
100
0
54
22
29
25
22
1.99
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28
3.4
28
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0
156
32
29
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29
1.88
9249264--9249348
40
2.1
40
84
4
109
35
29
14
21
1.92
9251129--9251176
22
2.1
23
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3
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47
0
2
50
1.12
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15
3.2
15
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21
50
50
0
0
49
1.00
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1.9
18
100
0
70
45
28
2
22
1.67
9255688--9255732
23
2.0
23
95
0
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26
24
2
46
1.64
9259610--9259668
29
2.0
29
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3
82
61
1
5
32
1.28
9259623--9259677
29
1.9
29
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3
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63
1
7
27
1.31
9259878--9259960
9
8.7
9
74
10
58
31
6
0
62
1.19
9259878--9259960
19
4.3
19
79
10
80
31
6
0
62
1.19
9260120--9260292
88
2.0
86
82
5
213
32
10
15
41
1.81
9260497--9260721
84
2.6
85
78
12
239
34
15
9
40
1.80
9260977--9261050
19
3.9
18
79
10
67
36
2
0
60
1.11
9260985--9261029
10
4.7
10
89
5
58
35
4
0
60
1.17
9260977--9261030
9
5.8
9
91
4
63
35
3
0
61
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9265289--9265433
79
1.9
76
86
4
209
56
10
5
27
1.55
9265629--9265760
33
4.0
32
80
6
131
28
11
46
13
1.78
9265629--9265755
66
1.9
66
84
6
168
29
10
46
14
1.77
9265647--9265783
33
4.2
33
79
7
98
28
10
45
15
1.80
9265631--9265783
66
2.3
66
80
8
159
29
11
44
15
1.80
9267926--9268136
51
4.2
51
93
0
352
33
12
21
32
1.91
9267926--9268139
102
2.1
101
96
0
392
33
12
21
32
1.91
9271494--9271677
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3.1
60
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0
323
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10
0
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27
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10
1
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1.42
9272547--9272588
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325