Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  60  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18321336--18321396
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3
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0
0
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0.97
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40
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138
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0
1.22
18322215--18322271
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0
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1.55
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0
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0
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1.37
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1.99
18322609--18322857
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0
0
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10
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3
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1.10
18325922--18325963
20
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20
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2
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1.06
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52
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2
2
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16
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2
50
1.32
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43
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1.60
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2.0
43
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100
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1.56
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1.98
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193
24
29
20
26
1.99
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5.8
48
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135
24
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20
27
1.99
18347947--18348402
187
2.4
186
88
3
659
23
28
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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91
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20
26
1.99
18347945--18348451
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5.4
95
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362
23
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20
27
1.99
18349123--18349290
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3.6
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19
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1.9
93
93
0
301
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5.4
15
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12
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93
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2.2
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1.98
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27
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1.99
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1.98
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22
20
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18376423--18376525
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1.9
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22
20
1.96
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2.6
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25
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44
2.0
44
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21
2.1
22
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13
0
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2.1
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1.9
38
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5
94
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1
1
38
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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19
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2
0
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1.03
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2.1
19
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5.6
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57
17
0
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48
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18464884--18465261
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15
0
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2.2
21
85
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60
6
17
42
34
1.74
18469741--18469787
7
6.7
7
100
0
94
57
14
0
27
1.38
18470940--18470981
22
2.0
21
86
13
59
52
4
16
26
1.63
18474266--18474373
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
18475970--18476128
27
5.9
27
84
11
195
18
25
22
33
1.96
18475966--18476128
54
3.0
54
91
6
244
18
25
22
34
1.96
18475970--18476128
81
2.0
80
86
8
225
18
25
22
33
1.96
18481330--18481395
23
2.8
24
77
6
73
56
6
0
37
1.24
18486456--18486524
16
4.3
16
77
12
70
62
0
1
36
1.04
18486455--18486520
24
2.9
23
78
15
66
63
0
1
34
1.04
18486473--18486522
26
1.9
26
84
15
68
60
0
2
38
1.09
18486647--18486689
17
2.5
17
78
14
52
62
2
0
34
1.08
18488550--18488932
176
2.2
173
86
3
520
26
19
19
33
1.96
18488550--18489010
176
2.6
172
83
5
496
26
19
20
32
1.97
18501083--18501130
17
2.8
18
81
12
66
58
0
2
39
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18501075--18501137
16
3.9
16
76
13
67
61
0
1
36
1.05
18501074--18501139
24
2.8
24
78
15
68
63
0
1
34
1.04
18501071--18501306
101
2.3
102
77
13
240
60
2
4
33
1.28
18502168--18502206
18
2.1
18
85
9
51
0
17
17
64
1.30
18511857--18511938
40
2.0
40
81
4
94
40
14
14
30
1.86
18514550--18514684
66
2.0
66
91
0
216
42
20
8
28
1.81
18527376--18527659
69
4.2
69
79
8
266
22
21
18
36
1.95
18527505--18527626
60
2.0
60
88
0
181
21
19
18
40
1.92
18527617--18527722
51
2.1
51
100
0
212
26
16
17
38
1.92
18536694--18536727
14
2.5
13
86
9
50
52
11
17
17
1.73
18537220--18537257
19
2.0
19
94
0
67
39
0
18
42
1.50
18537773--18537829
28
2.0
28
96
0
105
28
19
24
28
1.98
18540048--18540098
25
2.0
25
88
7
77
35
9
21
33
1.86
18540783--18540814
11
3.0
11
95
4
57
28
9
37
25
1.87
18544104--18544135
16
2.1
16
94
5
57
84
6
6
3
0.86
18547285--18547329
22
2.0
23
86
8
65
24
4
2
68
1.19
18558696--18558731
15
2.5
15
95
4
65
61
5
11
22
1.50
18603715--18603762
24
2.0
25
84
12
64
50
2
4
43
1.33
18603930--18604046
54
2.1
54
81
7
130
33
14
23
28
1.94
18610733--18610838
29
3.7
29
67
18
85
24
13
15
47
1.81
18620182--18620248
31
2.2
30
79
12
73
32
11
26
28
1.92
18620198--18620260
31
2.0
31
100
0
126
30
9
28
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18633820--18633873
19
2.7
19
81
15
65
33
0
1
64
1.04
18633869--18633908
20
2.0
20
85
0
53
47
2
2
47
1.29
18635340--18635370
3
10.3
3
92
0
53
35
29
0
35
1.58
18667905--18667929
12
2.1
12
100
0
50
40
8
28
24
1.83
18670170--18670228
31
1.9
31
92
0
100
25
1
11
61
1.40
18670333--18670548
107
2.0
108
89
0
335
36
8
10
44
1.70
18670947--18670988
20
2.1
20
82
8
50
61
2
7
28
1.35
18681977--18682054
29
2.6
29
80
11
86
58
1
2
37
1.20
18685023--18685385
46
7.7
46
72
14
178
23
27
19
28
1.99
18685172--18685385
46
4.6
45
78
10
200
23
29
20
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325