Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  302  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98186246--98186329
28
3.2
28
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25
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23
16
29
29
1.96
98186142--98186373
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4.7
49
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2
266
26
18
26
28
1.98
98186141--98186419
150
1.9
150
83
1
362
27
18
25
28
1.98
98187837--98187872
18
2.0
18
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0
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22
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98188915--98188972
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18
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0
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0
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0
0
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0.98
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1.9
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0
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1.12
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57
0
0
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3
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65
3
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1.35
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15
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53
1
0
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131
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4
469
34
17
19
28
1.95
98226311--98226569
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3.2
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66
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204
22
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0
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2.5
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2.6
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0
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28
23
18
28
1.98
98241619--98242128
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3.0
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4
449
24
24
21
29
1.99
98241968--98242236
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2.0
133
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0
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23
20
28
1.98
98242385--98242412
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98243335--98243384
25
2.0
25
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3
75
48
4
10
38
1.56
98251648--98251681
10
3.4
10
92
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52
70
0
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20
1.13
98251634--98251680
16
2.9
16
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1.27
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21
2.0
21
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0
0
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0.90
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1
0
24
0.92
98253274--98253327
16
3.5
15
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12
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1
0
24
0.92
98253283--98253329
15
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76
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0
0
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21
2.1
23
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2
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1.34
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2.0
21
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4
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98270637--98270693
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15
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0
0
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0
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1.00
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2.0
351
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14
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2.0
21
100
0
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1.57
98286287--98286342
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2.2
27
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1
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2.0
23
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0
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0
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0
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1.00
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3.1
22
81
11
83
23
24
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98310136--98310218
5
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5
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20
3
1.15
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0
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0
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3.8
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71
0
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2
0.97
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19
2.6
19
93
3
82
44
0
28
28
1.55
98315813--98315853
19
2.1
20
86
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57
31
9
2
56
1.45
98316272--98316339
12
5.5
12
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19
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2
20
2
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1.09
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21
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0
26
0
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0.83
98316264--98316309
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11.2
4
82
13
58
0
26
0
73
0.83
98316264--98316335
17
3.7
19
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14
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2
22
2
72
1.11
98318121--98318170
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20
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58
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1.29
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2.0
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1.71
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10
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2.0
23
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30
1.79
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23
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1.79
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1.66
98333189--98333231
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21
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1.63
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100
0
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32
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1.81
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25
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16
26
1.97
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9
5.5
8
87
12
65
13
8
0
77
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98347380--98347420
9
4.7
9
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6
66
12
9
0
78
0.98
98347375--98347419
17
2.7
17
90
10
67
13
8
0
77
0.98
98347456--98347503
18
2.7
17
81
9
60
29
4
0
66
1.10
98347537--98347577
20
2.0
20
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57
36
0
0
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0.95
98347499--98347580
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3.7
22
68
23
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42
0
2
54
1.13
98347600--98347670
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1.9
36
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2
106
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1
4
50
1.30
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10
10.4
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11
54
51
3
2
43
1.29
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2.0
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3
98
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3
0
41
1.17
98348417--98348453
19
1.9
19
89
10
58
62
0
0
37
0.96
98348411--98348502
35
2.7
33
77
14
98
56
1
0
42
1.06
98351906--98351998
30
3.1
30
81
6
107
30
26
18
24
1.98
98354947--98354994
16
2.8
18
75
15
57
39
0
0
60
0.97
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31
1.9
31
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77
60
0
1
38
1.07
98355118--98355169
23
2.2
24
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10
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55
3
0
40
1.18
98355477--98355546
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28
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0
0
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0.99
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0
0
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98355718--98355763
13
3.4
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1.27
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2
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1.12
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2
0
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1.12
98355883--98355934
18
2.9
18
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5
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67
0
3
28
1.08
98355959--98356026
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15
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77
0
8
13
0.98
98355940--98356021
39
2.1
38
84
6
103
79
1
8
10
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98355978--98356007
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0
60
80
0
10
10
0.92
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30
2.7
29
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13
81
78
1
8
11
1.02
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19
3.2
20
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14
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58
3
1
37
1.24
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3
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3
100
0
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34
0
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1.58
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31
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31
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0
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12
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1.32
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12
10
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1.74
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20
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49
14
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25
1.76
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2.1
42
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0
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13
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12
0
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0
0
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24
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1
0
40
1.09
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26
16
26
29
1.97
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3.0
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4
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27
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14
100
0
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14
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14
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20
0
0
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10
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16
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79
9
0
11
0.93
98425328--98425359
11
3.0
11
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4
57
81
9
0
9
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28
2.1
30
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1
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17
1.11
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64
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33
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12
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1.9
145
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26
1.96
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181
3.8
181
88
3
958
30
17
23
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98435199--98435237
17
2.2
17
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4
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84
7
0
7
0.77
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14
2.1
14
100
0
58
58
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20
1.58
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2.0
86
88
2
262
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15
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1.84
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23
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0
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0
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4
0
17
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0
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7
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0
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100
0
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1.84
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14
2.0
14
100
0
56
42
7
14
35
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325