Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  29  of  325  ( 38900 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8790038--8790108
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27
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0
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8790038--8790108
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0
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1.11
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331
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19
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1.97
8813334--8813372
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2.5
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5
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3.0
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1.22
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20
2.1
20
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2
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1.29
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2.6
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1
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8829916--8830135
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1.9
22
85
0
57
59
7
7
26
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8834788--8834858
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2.8
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1.9
20
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3.0
30
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20
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1.93
8836357--8836691
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18
17
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8836522--8837138
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19
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223
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2.0
20
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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50
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0
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2.0
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0
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2.0
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2
5
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19
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1
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2.0
54
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0
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13
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20
5.1
21
70
6
97
25
8
10
55
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8955333--8955458
41
3.1
39
75
13
121
24
11
10
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1.67
8956093--8956160
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100
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1.81
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1.51
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19
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2.1
27
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14
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1.58
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0
0
42
0.98
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38
2.2
38
83
8
102
61
1
1
36
1.12
8969641--8969670
15
1.9
16
93
6
53
30
3
0
66
1.07
8970675--8970733
31
1.9
31
100
0
118
40
3
0
55
1.16
8970717--8970778
29
2.1
30
81
3
72
61
8
3
27
1.40
8973981--8974020
20
2.0
20
90
0
62
27
10
12
50
1.72
8973967--8974032
35
1.9
34
90
6
107
31
7
13
46
1.71
8973960--8974036
14
5.0
15
71
20
52
32
7
15
44
1.75
8976515--8976562
12
3.9
12
78
10
53
37
0
58
4
1.18
8976511--8976568
18
3.2
18
80
9
64
36
0
60
3
1.14
8976515--8976550
13
2.8
13
91
4
56
36
0
58
5
1.22
8983436--8984192
80
10.1
73
70
21
366
32
17
17
33
1.93
8983546--8984192
69
8.6
73
71
20
309
31
17
17
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8983700--8983903
82
2.5
81
83
12
242
32
17
16
33
1.92
8984384--8984576
78
2.6
74
81
12
229
30
15
17
36
1.91
8984373--8984623
76
3.4
73
72
21
204
30
16
18
34
1.93
8984899--8985429
144
3.7
139
77
18
531
35
18
18
28
1.94
8984856--8985485
144
4.3
147
77
17
418
35
18
18
27
1.94
8997144--8997186
11
3.9
11
81
0
50
60
4
0
34
1.17
8997709--8997743
11
3.1
12
88
12
56
48
0
51
0
1.00
8997841--8997890
10
5.1
10
72
13
50
22
0
4
74
0.99
8999149--8999865
72
9.5
72
77
11
627
33
19
16
31
1.94
8999149--8999886
223
3.3
224
85
6
954
33
19
15
31
1.93
8999655--8999865
77
2.8
74
85
7
268
31
19
16
33
1.94
8999495--8999812
165
2.0
160
86
4
440
34
19
16
29
1.93
8999418--8999953
238
2.3
233
84
3
680
34
19
15
30
1.93
9000056--9000100
13
3.4
13
78
6
54
66
8
8
15
1.43
8999892--9000172
100
2.8
101
87
2
397
38
19
17
24
1.93
9000080--9000247
73
2.3
74
88
3
250
33
20
17
28
1.95
9012699--9012741
11
3.9
11
81
0
50
60
4
0
34
1.17
9013231--9013266
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00
9013233--9013276
11
4.1
11
88
8
56
43
0
56
0
0.99
9013749--9013799
18
2.8
18
87
0
84
3
0
43
52
1.19
9015702--9015776
22
3.3
22
73
10
60
58
5
5
30
1.43
9015713--9015920
23
8.6
25
69
14
96
56
4
6
33
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9016209--9016247
16
2.4
16
86
0
51
43
28
5
23
1.75
9016405--9016500
30
3.2
30
95
0
174
17
6
50
26
1.70
9016440--9016493
18
3.3
18
66
28
57
18
7
50
24
1.72
9019596--9020421
84
9.8
84
87
2
1014
35
21
23
19
1.96
9019935--9020065
44
3.1
44
67
20
132
34
25
22
16
1.95
9020232--9020376
44
3.3
44
68
11
116
33
21
22
22
1.97
9020269--9020420
44
3.5
43
71
12
121
30
21
25
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1.99
9020908--9020957
5
9.6
5
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20
0
6
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12
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27
6
0
65
1.18
9021556--9021603
15
3.1
15
90
6
69
29
8
0
62
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325