Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  43  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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22
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82
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28
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1.8
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24
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1
33
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13032371--13032427
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3.5
16
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1
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0
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10
14
44
1.79
13049386--13049879
44
11.2
44
90
0
729
30
14
26
28
1.95
13051514--13051570
14
4.2
13
82
10
53
33
7
1
57
1.36
13051516--13051581
15
4.6
15
78
16
68
30
6
3
60
1.36
13051546--13051618
3
23.3
3
74
18
60
32
2
1
63
1.17
13051547--13051615
21
3.3
21
81
4
77
33
2
1
62
1.19
13051562--13051633
27
2.8
27
79
10
71
34
2
1
61
1.19
13052534--13052700
80
2.1
80
97
0
316
30
10
14
44
1.79
13060543--13060648
44
2.4
41
75
21
108
39
2
0
56
1.20
13060578--13060629
21
2.4
22
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12
63
40
3
0
55
1.18
13061708--13061759
20
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19
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8
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53
0
1
44
1.11
13062254--13062430
88
2.0
91
83
5
225
44
3
10
41
1.56
13075035--13075108
31
2.4
31
93
0
121
13
28
35
22
1.92
13078869--13078904
4
9.0
4
87
0
54
25
44
2
27
1.68
13080312--13080365
27
2.0
27
100
0
108
51
25
0
22
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13091627--13091676
6
8.2
6
89
8
66
18
0
12
70
1.17
13095473--13095614
9
15.3
9
68
19
78
57
14
2
25
1.48
13095436--13095619
38
4.9
38
79
12
202
57
14
2
26
1.49
13102894--13102926
16
2.1
16
94
0
57
18
21
12
48
1.80
13113867--13113928
23
2.8
22
75
15
65
70
0
17
11
1.15
13117208--13117305
19
5.2
19
90
7
155
36
10
16
36
1.82
13117208--13117305
36
2.6
37
87
9
144
36
10
16
36
1.82
13122869--13122897
14
2.0
15
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6
51
75
0
17
6
1.01
13123753--13124196
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10.1
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12
305
30
16
24
28
1.97
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3.5
88
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372
30
16
25
28
1.97
13123749--13124103
175
2.0
175
92
1
586
30
15
25
29
1.96
13123872--13124196
132
2.5
132
93
0
551
30
16
24
28
1.96
13123754--13124096
88
3.9
87
77
9
365
30
16
25
28
1.96
13124183--13124972
206
3.8
206
94
0
1301
30
17
22
29
1.97
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19
5.2
19
87
9
146
37
9
16
37
1.81
13125360--13125456
35
2.6
37
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11
135
37
9
16
37
1.81
13127952--13127994
21
2.0
21
100
0
86
46
4
4
44
1.45
13128397--13128450
28
2.0
27
85
7
74
50
5
11
33
1.61
13130680--13130722
3
14.3
3
85
0
59
62
4
2
30
1.28
13130942--13131052
12
9.3
11
68
17
53
65
4
5
24
1.32
13132756--13132812
29
1.9
30
85
3
80
28
1
15
54
1.52
13133813--13133864
18
2.7
18
79
8
50
32
5
0
61
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13134348--13134393
14
3.5
13
82
11
58
52
4
2
41
1.33
13137904--13137942
18
2.2
18
85
0
51
66
5
10
17
1.39
13143484--13143579
41
2.3
41
85
0
120
23
32
28
15
1.95
13143854--13143918
19
3.2
20
76
16
71
23
4
1
70
1.14
13143842--13143914
22
3.4
22
77
9
78
20
5
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69
1.25
13143829--13143922
43
2.2
45
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140
21
4
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71
1.18
13146939--13146993
27
2.0
27
100
0
110
43
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23
25
1.79
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2.2
50
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143
28
13
26
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1.94
13163942--13164015
32
2.3
32
83
0
94
22
17
28
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325