Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  47  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14061811--14061879
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128
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2.8
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13
0
42
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.20
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13
0
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18
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17
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22
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15
26
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.98
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0
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2.5
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1.94
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52
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1
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0.90
14242237--14242347
44
2.5
42
78
17
109
71
0
2
25
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14242284--14242371
37
2.4
36
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9
90
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1
3
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1.13
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0
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0
46
1.51
14280071--14280095
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
14283426--14283462
18
2.0
19
94
5
67
45
16
10
27
1.80
14285017--14285049
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
14287503--14287549
24
2.1
21
81
18
51
76
12
4
6
1.12
14288326--14288361
19
1.9
18
94
5
63
55
0
2
41
1.14
14289531--14290173
299
2.1
299
83
4
785
35
13
11
39
1.81
14290365--14290405
19
2.2
19
100
0
82
17
34
29
19
1.94
14290372--14290413
19
2.2
19
91
0
66
16
33
30
19
1.94
14290403--14290459
29
1.9
30
82
3
71
29
36
22
10
1.88
14291521--14291581
19
3.3
19
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8
65
24
0
3
72
1.00
14292035--14292080
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
14292042--14292086
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
14293421--14293616
106
1.8
106
98
0
383
38
11
10
39
1.76
14299045--14299105
25
2.4
25
88
0
95
27
24
26
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14301310--14301650
169
2.0
169
99
0
673
32
14
14
38
1.87
14302495--14302562
34
2.0
34
91
0
109
23
23
11
41
1.87
14305592--14305650
25
2.4
25
94
0
100
27
18
23
30
1.98
14307655--14307759
46
2.3
44
78
16
115
11
11
6
70
1.33
14308615--14308672
20
2.9
20
80
17
59
77
3
13
5
1.07
14311469--14311518
25
2.0
25
100
0
100
24
8
20
48
1.76
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13
2.1
13
100
0
54
14
14
29
40
1.86
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26
4.2
26
91
0
180
37
24
6
32
1.81
14324304--14324330
14
1.9
14
100
0
54
37
0
18
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1.50
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15
2.3
15
90
0
52
40
8
14
37
1.76
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23
2.0
23
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64
0
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1.13
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26
2.2
26
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0
94
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10
5
41
1.62
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26
2.0
26
100
0
104
42
11
3
42
1.59
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2
12.5
2
100
0
50
0
48
0
52
1.00
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9
5.3
9
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18
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33
12
10
43
1.77
14330577--14330627
18
2.8
18
90
0
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31
13
11
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1.80
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30
2.7
30
76
11
74
31
15
7
45
1.75
14334670--14334730
27
2.3
27
80
13
72
27
0
6
65
1.17
14337392--14337432
19
2.1
19
86
9
55
73
0
26
0
0.84
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46
7.0
46
93
0
437
40
13
23
22
1.89
14341419--14341468
10
5.0
10
83
9
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68
2
6
24
1.23
14343849--14343878
6
5.0
6
100
0
60
16
66
0
16
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14345456--14345493
20
1.9
20
84
10
51
42
10
0
47
1.38
14350679--14350762
33
2.6
32
77
9
80
38
15
16
29
1.90
14350657--14350867
103
2.1
101
83
5
255
32
16
22
28
1.96
14352232--14352319
44
2.0
44
100
0
176
43
13
13
29
1.83
14354996--14355113
25
4.7
25
77
4
87
33
22
25
19
1.97
14355097--14355151
24
2.3
24
81
6
67
34
21
23
20
1.97
14374418--14374456
21
1.9
20
84
5
51
38
2
20
38
1.66
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24
2.3
24
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0
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23
27
18
30
1.97
14375041--14375217
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2.4
73
77
9
191
20
25
18
35
1.95
14375073--14375192
25
4.8
25
87
2
170
22
27
17
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325