Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  36  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10818396--10818476
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42
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0
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19
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1.9
42
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108
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1.9
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44
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14
29
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0
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10842399--10842434
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30
2
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66
1.06
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2.0
17
88
5
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2
0
62
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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2.2
145
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602
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13
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36
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4
41
1.42
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2.6
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4
2
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22
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0
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0
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2
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.96
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23
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26
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1.24
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2.6
15
84
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55
78
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14
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10985743--10985774
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2.0
16
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0
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26
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93
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0
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21
29
27
1.98
11006253--11006296
23
1.9
23
85
0
61
36
11
22
29
1.89
11011101--11011276
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
11011098--11011269
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
11012563--11012743
90
2.0
89
86
1
254
33
14
23
28
1.94
11012585--11012769
90
2.1
90
83
4
230
34
16
22
26
1.95
11014746--11014784
13
3.0
13
84
0
51
41
5
7
46
1.55
11017666--11017717
26
2.0
26
100
0
104
26
0
0
73
0.84
11024513--11024683
45
3.8
45
80
14
206
21
21
28
29
1.98
11024510--11024678
92
1.8
92
93
2
295
21
21
28
28
1.98
11032046--11032218
45
3.8
46
79
13
187
21
21
28
28
1.98
11032050--11032220
46
3.7
45
79
12
204
21
21
28
29
1.98
11032445--11032482
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
11037056--11037103
17
2.6
17
83
9
60
14
20
45
18
1.85
11038551--11038583
17
1.9
17
93
0
57
60
6
18
15
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11038749--11038788
10
4.0
10
81
12
55
22
7
2
67
1.28
11041759--11041821
30
2.1
30
90
0
99
23
4
14
57
1.56
11044859--11044893
17
2.1
17
88
0
52
54
0
0
45
0.99
11050073--11050196
59
2.1
60
81
4
153
47
15
12
24
1.80
11050164--11050340
85
2.1
85
83
4
216
41
10
13
33
1.79
11050692--11050738
14
3.4
14
78
18
53
68
2
0
29
1.02
11051072--11051098
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
11053604--11053789
40
4.7
40
89
4
261
21
22
25
30
1.99
11055147--11055186
18
2.2
18
100
0
80
27
0
17
55
1.43
11058023--11058153
45
2.9
45
84
4
165
40
14
22
22
1.90
11058308--11058459
27
5.6
27
72
0
97
37
18
28
15
1.92
11061532--11061692
43
3.7
43
75
9
139
29
16
22
31
1.96
11062344--11062393
25
2.0
25
96
0
91
40
4
18
38
1.69
11070183--11070299
23
5.2
21
71
20
78
36
17
23
23
1.94
11084333--11084368
16
2.4
14
90
9
54
72
2
0
25
0.98
11084393--11084457
24
2.7
24
100
0
130
33
18
15
32
1.92
11088357--11088403
3
15.7
3
95
0
85
68
2
0
29
1.02
11092139--11092196
18
3.4
17
79
11
66
32
5
0
62
1.18
11092139--11092178
17
2.3
17
91
4
62
32
7
0
60
1.25
11092173--11092224
15
3.5
15
75
19
63
26
1
0
71
0.97
11092172--11092241
30
2.3
30
97
0
131
31
2
0
65
1.07
11092188--11092241
16
3.5
15
74
20
58
31
3
0
64
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11098878--11098923
20
2.3
20
92
0
74
39
0
2
58
1.10
11099340--11099389
19
2.7
18
81
6
55
66
4
2
28
1.21
11099826--11099903
32
2.5
31
81
12
88
55
10
3
30
1.51
11102016--11102062
20
2.3
21
85
3
60
55
0
2
42
1.12
11108792--11108837
15
2.9
16
73
26
53
63
2
4
30
1.26
11109922--11109982
26
2.4
25
83
10
70
50
1
0
47
1.10
11109945--11110002
26
2.2
28
81
12
77
48
5
1
44
1.35
11112179--11112223
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
11115957--11115998
22
1.9
22
90
0
66
33
2
14
50
1.56
11121275--11121506
125
1.9
124
83
5
299
31
9
4
53
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325