Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  209  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67688927--67689142
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100
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1.8
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21
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28
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1.8
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0
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1.98
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29
21
20
1.98
67707985--67708054
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2.1
25
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0
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4
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20
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4.8
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20
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27
20
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2.0
81
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19
28
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1.98
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2.1
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3
50
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20
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1
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1
1
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1.13
67755582--67755641
8
7.4
8
74
22
54
38
1
0
60
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67755574--67755655
5
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1
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4.0
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1.91
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17
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1.96
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0
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27
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27
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0
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1.8
169
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2.4
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30
17
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30
1.96
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3.5
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28
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3.5
40
88
3
181
23
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
30
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28
1.98
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18
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22
1.98
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1.99
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31
1.95
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2.1
74
89
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233
24
16
28
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67981535--67981586
27
1.9
27
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1.95
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104
2.2
103
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2
367
17
18
31
31
1.95
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2.1
72
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243
23
16
29
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1.96
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2.1
35
92
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30
22
1.98
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42
3.2
42
95
0
241
34
19
14
32
1.91
68006742--68006820
25
3.2
24
75
8
79
27
22
21
27
1.99
68007629--68007693
27
2.4
27
87
5
87
21
21
16
40
1.92
68007723--68007879
27
5.7
27
76
8
102
31
7
19
41
1.80
68007836--68007947
27
4.2
26
84
5
125
30
8
22
38
1.85
68007937--68008131
27
7.2
27
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0
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41
9
22
27
1.85
68007937--68008131
81
2.4
81
95
0
354
41
9
22
27
1.85
68010515--68010737
40
5.6
40
93
0
374
22
28
21
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1.99
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19
2.1
19
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0
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20
15
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1.92
68014974--68015003
15
2.0
15
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26
1.88
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0
4
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1.22
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22
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0
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0
3
46
1.20
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11
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10
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12
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0
17
0
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0.67
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3
19.7
3
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0
91
27
3
0
69
1.04
68022695--68022752
30
2.0
30
83
10
75
46
13
6
32
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68025459--68025632
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7.0
25
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0
285
27
10
11
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45
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45
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21
26
27
1.99
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2.0
26
100
0
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18
11
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1.86
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45
2.9
44
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25
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26
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0
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20
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1.98
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0
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50
0
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0
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126
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1
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250
2.6
251
87
0
921
38
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18
28
1.90
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2.1
37
100
0
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15
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0
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2.0
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20
20
29
29
1.98
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1.8
93
94
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20
20
29
28
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7
516
29
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18
30
1.97
68156145--68156187
17
2.6
17
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3
52
41
20
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1.73
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2.0
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19
2.2
19
95
0
73
53
21
7
17
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68166281--68166333
27
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28
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43
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42
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24
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19
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19
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0
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68195073--68195108
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0
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0
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0
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2.2
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45
0
0
54
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325