Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  310  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100445438--100445465
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0
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0
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400
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174
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1.98
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4.1
86
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2
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26
22
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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145
35
22
16
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
122
37
9
19
32
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.95
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31
1.95
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14
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54
7
0
38
1.28
100653401--100653444
22
2.0
22
100
0
88
63
4
13
18
1.46
100653802--100653853
27
2.0
27
82
17
65
46
5
0
48
1.26
100653895--100653939
18
2.5
17
82
10
54
31
4
2
62
1.27
100663294--100663322
13
2.1
14
93
6
51
24
6
20
48
1.74
100663637--100663953
131
2.5
129
84
4
399
29
18
17
33
1.94
100664939--100664978
21
1.9
21
89
0
62
17
12
12
57
1.65
100665322--100665359
18
2.2
18
85
4
51
50
2
0
47
1.15
100666218--100666288
36
1.9
37
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2
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30
12
4
52
1.58
100669533--100669570
19
2.0
19
100
0
76
52
0
10
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100670564--100670606
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2.0
21
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0
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2
11
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100676526--100676601
6
12.2
6
70
13
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72
3
22
1
1.09
100676526--100676601
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22
1
1.09
100677509--100677606
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1
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25
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100678276--100678336
32
1.9
32
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3
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3
1.07
100678295--100678354
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2.4
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73
18
5
3
1.16
100680834--100680869
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100690487--100690722
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5.8
41
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4
302
27
27
22
22
1.99
100692673--100692838
72
2.3
71
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4
253
22
15
21
40
1.90
100692771--100693258
140
3.5
140
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1
897
25
17
20
37
1.94
100693096--100693129
13
2.5
13
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4
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20
11
8
58
1.59
100693178--100693403
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3.0
72
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10
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18
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1.94
100693357--100693452
49
2.0
49
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0
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2.0
121
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0
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19
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1.94
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1.8
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19
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2.1
30
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19
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2.4
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2.0
27
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0
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2.1
25
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0
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9
44
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1.8
170
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424
28
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13
46
1.77
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3.1
15
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0
2
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13
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22
7
0
70
1.12
100711384--100711420
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1.9
20
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0
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1.32
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0
332
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14
23
20
1.90
100713597--100713879
138
2.1
137
85
2
370
41
15
22
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100713597--100713879
92
3.1
91
83
3
318
41
15
22
20
1.90
100715733--100715780
16
3.1
15
75
19
53
27
2
2
68
1.11
100715719--100715789
11
6.5
11
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2
2
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1.22
100719843--100719870
3
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100
0
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0
0
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0
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19
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100
0
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16
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2.0
19
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5
51
41
2
0
56
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325