Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  215  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70019921--70019985
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24
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13
24
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0
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1.69
70021503--70021548
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2.3
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1.96
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1.97
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26
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1.97
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0
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2.1
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100
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54
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2.2
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2.7
35
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12
104
58
2
1
38
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
5
0
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1.20
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5.5
19
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15
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35
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0
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1.30
70083737--70083843
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1.17
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1.01
70083823--70083862
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75
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1.20
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2.2
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2.0
26
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50
15
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1.44
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10
6.7
10
73
9
59
45
1
0
52
1.09
70110417--70110480
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3.9
16
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2
83
45
1
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1.10
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2
16
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0
0
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1.31
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2.0
43
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10
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13
50
66
2
10
22
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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0
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0.97
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5
17.4
5
76
21
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76
0
3
20
0.92
70132253--70132342
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2.2
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75
20
62
76
0
3
20
0.92
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1.98
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27
19
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1.97
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1.87
70143386--70143790
96
4.3
96
93
2
680
32
8
30
29
1.87
70143386--70143790
143
2.9
141
91
2
650
32
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30
29
1.87
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1.52
70158446--70158503
26
2.2
25
82
8
71
34
1
1
62
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70162374--70162403
14
2.1
14
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0
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46
1.64
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1
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2.0
22
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9
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60
1.47
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0
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0
0
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0
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2
50
1.60
70180883--70181791
455
2.0
455
98
0
1737
29
15
27
28
1.96
70187882--70187950
25
2.8
24
78
10
77
27
20
18
33
1.96
70187869--70187965
49
2.0
49
87
0
140
25
20
19
34
1.96
70187869--70187950
24
3.4
24
75
9
85
26
20
19
32
1.97
70187962--70188020
25
2.4
25
76
0
64
25
20
22
32
1.98
70192412--70192580
93
1.8
93
90
0
275
28
28
21
21
1.99
70192405--70192580
46
3.8
46
77
10
187
28
28
21
21
1.98
70192456--70192592
47
3.0
46
71
16
122
29
27
19
22
1.98
70206748--70206775
11
2.5
11
100
0
56
21
17
35
25
1.95
70206763--70207101
46
7.2
48
76
8
236
28
20
27
24
1.99
70209048--70209142
27
3.4
28
89
2
129
26
12
28
32
1.93
70209073--70209155
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
70211159--70211252
42
2.2
42
90
0
152
14
27
35
22
1.94
70218363--70218430
34
2.0
34
97
0
127
22
11
17
48
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70223961--70224099
48
2.9
47
83
3
170
26
18
30
24
1.98
70237257--70237482
48
4.7
46
78
6
227
27
19
28
24
1.98
70237254--70237484
96
2.4
97
81
2
261
27
19
28
24
1.99
70241055--70241122
29
2.3
29
92
0
109
20
25
7
47
1.76
70242783--70243169
50
7.7
50
78
2
398
29
24
17
28
1.98
70242775--70243216
151
2.9
151
87
2
602
30
24
17
27
1.97
70242783--70243169
101
3.9
101
78
3
395
29
24
17
28
1.98
70242772--70243216
50
8.8
50
78
3
329
30
24
17
27
1.97
70245075--70245133
10
5.9
10
86
7
75
66
1
10
22
1.31
70245740--70245931
99
1.9
101
85
4
264
32
24
14
28
1.94
70248438--70248657
40
5.6
40
80
5
241
25
26
22
25
2.00
70256536--70256746
40
5.3
40
80
3
221
27
26
21
24
1.99
70259892--70259990
28
3.6
28
78
6
103
19
23
22
35
1.96
70259892--70260003
27
4.1
26
80
8
116
18
22
21
37
1.94
70265758--70265913
82
1.9
81
85
3
215
26
16
28
28
1.97
70265757--70265910
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
70265758--70265913
27
5.7
27
81
6
163
26
16
28
28
1.97
70265750--70265934
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
70265750--70265934
82
2.3
81
78
2
210
26
16
28
29
1.97
70273810--70273965
82
1.9
81
85
3
215
26
16
28
28
1.97
70273809--70273962
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
70273810--70273965
27
5.7
27
81
6
163
26
16
28
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70273802--70273986
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
70273802--70273986
82
2.3
81
78
2
210
26
16
28
29
1.97
70279960--70280002
21
2.0
21
100
0
86
23
23
27
25
2.00
70286044--70286157
43
2.7
42
69
11
97
25
15
23
35
1.95
70299614--70299747
55
2.4
55
93
0
223
26
13
24
35
1.92
70304490--70304597
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
70305014--70305088
5
14.8
5
71
18
57
74
0
1
24
0.89
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9.4
7
77
16
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0
1
25
0.92
70305016--70305088
22
3.3
22
79
11
87
73
0
1
24
0.90
70305014--70305088
27
2.5
27
83
14
78
74
0
1
24
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325