Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  259  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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14
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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26
29
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
331
22
27
23
26
1.99
84728184--84728208
11
2.3
11
100
0
50
76
8
0
16
1.02
84730306--84730352
22
2.1
21
84
11
58
21
27
36
14
1.93
84736465--84736709
40
6.1
40
94
2
379
22
23
28
26
1.99
84744537--84744774
40
5.9
40
94
2
365
23
22
27
26
1.99
84763664--84763764
43
2.3
43
89
0
148
33
20
16
28
1.95
84765954--84766124
43
4.0
43
81
6
186
28
14
24
32
1.94
84765957--84766119
86
1.9
85
83
3
211
28
15
24
31
1.95
84767078--84767197
52
2.3
52
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0
204
50
10
22
17
1.76
84768425--84768681
40
6.5
40
86
2
306
23
23
28
24
2.00
84772065--84772332
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48
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28
28
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24
1.98
84772065--84772333
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2.8
96
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2
319
28
28
17
24
1.98
84772113--84772380
96
2.8
96
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1
342
29
29
16
24
1.97
84772116--84772380
48
5.6
47
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4
246
29
29
16
24
1.97
84778532--84778705
46
3.8
45
77
7
136
23
29
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84785453--84785652
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3.9
51
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1
303
29
25
14
30
1.95
84785676--84785769
28
3.5
28
80
11
115
27
23
13
35
1.93
84785692--84785765
24
2.8
26
84
10
89
25
21
14
37
1.92
84796863--84797019
43
3.7
42
80
10
185
22
18
28
29
1.97
84796876--84797029
84
1.8
84
84
5
213
23
18
29
28
1.98
84799638--84799785
51
2.9
50
82
7
181
31
22
14
31
1.93
84799821--84799920
24
4.0
24
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101
23
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1.95
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2.3
52
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0
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1.96
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2.0
118
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2
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22
22
28
25
1.99
84805175--84805471
80
3.7
80
86
1
366
22
22
28
25
1.99
84805175--84805445
120
2.3
120
86
1
357
21
22
29
26
1.99
84808398--84808428
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1.9
16
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0
53
38
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1.69
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3.2
43
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26
17
25
1.97
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43
2.2
41
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7
114
33
22
17
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1.96
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1.9
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1.66
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25
2.0
25
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0
93
11
21
7
58
1.58
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26
2.4
26
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0
81
38
4
31
25
1.77
84825731--84825765
17
2.1
17
100
0
70
48
0
17
34
1.47
84827017--84828051
518
2.0
516
99
0
2025
51
10
14
23
1.73
84828601--84828682
6
13.3
6
69
23
55
50
14
17
18
1.79
84828612--84828682
31
2.3
31
92
4
117
50
14
16
18
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84828825--84828889
27
2.4
27
84
5
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35
23
23
18
1.96
84829047--84829105
22
2.7
22
83
0
73
32
22
25
20
1.98
84830442--84830572
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4.9
27
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25
20
11
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84830550--84830910
27
13.3
27
77
5
235
39
20
9
30
1.84
84830469--84830599
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2.4
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0
145
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22
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1.85
84830550--84830908
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54
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260
39
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1.83
84830550--84830824
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1.97
84831832--84831937
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4.2
26
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164
29
20
20
29
1.98
84832994--84833431
27
16.2
27
84
1
547
25
19
18
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325