Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  252  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82154053--82154156
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52
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0
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2.0
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0
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0
0
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0
0
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24
17
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3.2
42
79
9
131
25
17
25
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1.97
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5.1
101
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520
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16
23
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26
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101
1.8
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83
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244
29
27
19
24
1.98
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3.7
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20
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18
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1.54
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2.6
49
88
1
179
30
28
16
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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2.5
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50
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297
26
24
29
19
1.99
82206071--82206320
100
2.4
103
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364
26
24
29
20
1.99
82210913--82210970
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30
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0
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24
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1.71
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0
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240
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28
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1.99
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0
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18
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30
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1.82
82224824--82224888
6
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0
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9
30
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18
1.82
82224824--82224900
18
4.3
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7
29
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22
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2.4
14
100
0
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5
14
35
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3.8
46
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180
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21
30
28
1.98
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1.9
93
90
2
276
20
21
31
27
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1.9
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92
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6
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1
96
0
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1.00
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2.6
26
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13
4
2
79
0.99
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13
4
2
79
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82231161--82231209
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2.1
23
85
7
64
22
0
4
73
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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40
0
2
57
1.11
82231274--82231316
22
2.0
20
86
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59
39
0
2
58
1.11
82231398--82231427
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2.4
13
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5
53
56
0
0
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58
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0
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3.0
13
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44
2
0
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58
0
1
39
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21
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1.9
151
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5
473
59
4
4
31
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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127
21
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0
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0
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16
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1.84
82287847--82288029
79
2.3
81
82
7
214
24
22
27
25
2.00
82287847--82288031
40
4.7
40
82
6
216
24
22
28
25
1.99
82287884--82288064
79
2.3
78
76
9
188
27
20
27
24
1.99
82287928--82288064
40
3.5
40
82
5
120
25
22
28
23
1.99
82295945--82296065
47
2.6
47
94
0
206
33
6
31
28
1.83
82297484--82297628
43
3.4
43
99
0
283
22
15
35
26
1.94
82297610--82297683
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
82297994--82298269
40
6.9
40
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3
272
24
23
28
24
2.00
82297994--82298270
120
2.3
121
81
4
310
24
23
28
24
2.00
82302536--82302845
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47
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2
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32
8
30
29
1.86
82306774--82306898
29
4.3
29
89
1
189
31
30
12
25
1.93
82311250--82311305
29
1.9
29
88
0
85
33
33
8
23
1.86
82312915--82312955
17
2.3
18
91
4
66
24
12
4
58
1.53
82315399--82315425
6
4.5
6
100
0
54
85
0
0
14
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82329773--82329821
25
2.0
25
84
8
64
26
12
6
55
1.60
82334338--82334378
18
2.2
19
91
4
66
4
31
2
60
1.30
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37
3.9
37
96
0
254
26
31
18
23
1.97
82335697--82335832
50
2.7
50
94
2
229
30
25
7
36
1.83
82335879--82336001
22
5.3
22
65
24
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25
29
13
32
1.93
82335866--82336026
47
3.4
47
99
0
304
26
29
11
32
1.92
82335865--82336047
94
2.0
91
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8
228
30
27
10
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1.90
82340113--82340170
25
2.4
25
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1
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1.36
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18
2.2
19
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4
31
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63
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10
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37
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24
21
1.94
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1.8
110
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273
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25
22
1.95
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16
1.9
16
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0
53
41
0
22
35
1.54
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2.0
41
100
0
162
43
14
19
22
1.88
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37
2.1
37
85
0
104
27
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24
1.96
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7.5
47
94
0
589
29
29
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1.86
82360855--82360934
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3.0
26
80
3
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30
5
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57
1.48
82368375--82368764
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5.1
74
75
11
347
28
16
21
33
1.94
82368364--82368764
75
5.3
74
74
11
328
28
16
20
34
1.94
82368457--82368850
158
2.5
161
78
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449
28
15
20
35
1.94
82368616--82368753
72
1.9
73
86
5
199
31
15
21
31
1.95
82368744--82368778
14
2.5
14
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0
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17
17
5
60
1.55
82368833--82368866
16
2.1
16
88
0
50
20
8
5
64
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82368686--82369015
89
3.7
90
80
8
377
28
16
20
34
1.95
82371020--82371099
26
3.0
26
80
3
88
30
5
7
57
1.48
82373851--82374105
55
4.8
53
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10
211
36
17
24
21
1.95
82373858--82374058
108
1.8
110
85
4
282
34
17
24
23
1.96
82379798--82379827
3
9.7
3
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7
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0
3
30
1.07
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2
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82382263--82382380
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2
168
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20
95
0
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1.94
82388428--82388682
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5.5
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329
22
20
27
29
1.99
82406226--82406354
46
2.8
46
92
2
197
30
28
20
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325