Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  105315579

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  304  of  325  ( 38900 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98734012--98734071
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Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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29
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29
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98863428--98863657
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1
370
46
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1.76
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20
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61
0
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35
1.12
98879290--98879319
15
1.9
16
93
6
53
60
0
0
40
0.97
98883786--98883853
32
2.1
33
91
5
111
22
14
27
35
1.93
98889120--98889212
48
1.9
49
93
2
161
37
8
18
35
1.81
98892728--98892835
26
4.2
26
95
0
189
36
26
6
30
1.82
98895738--98895789
25
2.1
25
92
0
86
21
19
25
34
1.96
98899266--98899318
27
2.0
26
88
3
79
30
33
20
15
1.93
98899278--98899466
71
2.6
71
85
8
229
31
31
16
20
1.95
98899348--98899571
104
2.2
104
93
1
378
31
31
19
17
1.95
98901249--98901304
26
2.2
26
96
0
103
35
25
7
32
1.83
98912863--98912902
20
2.0
21
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5
55
65
0
2
32
1.06
98916775--98916882
44
2.4
44
84
3
135
31
23
12
33
1.91
98919763--98919859
47
2.1
46
83
9
117
46
9
14
29
1.76
98920609--98920736
62
2.0
63
96
1
240
17
26
6
49
1.71
98920708--98920776
29
2.3
30
95
2
122
11
28
0
59
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98921851--98922033
102
1.8
101
86
1
267
27
22
18
32
1.97
98927863--98927920
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
98928132--98928163
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
98928264--98928498
50
4.6
50
86
4
292
25
24
29
20
1.99
98928264--98928506
100
2.3
104
88
6
352
25
24
29
20
1.99
98936938--98937113
85
2.1
86
83
3
221
36
16
17
29
1.92
98936983--98937058
38
1.9
38
84
5
98
35
18
21
25
1.95
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19
2.2
19
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9
55
38
2
2
56
1.27
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4.9
18
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0
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1.77
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20
2.0
20
90
9
64
40
12
5
42
1.64
98943956--98944005
15
3.0
15
83
16
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40
14
2
44
1.56
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4
8.0
4
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12
50
23
2
0
73
0.97
98945174--98945207
9
4.0
8
88
11
50
23
2
0
73
0.97
98945173--98945207
13
2.7
13
90
0
61
22
5
0
71
1.07
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0
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1.38
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11
2.5
12
88
11
51
58
0
24
17
1.38
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5.4
34
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0
235
30
13
14
42
1.84
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19
2.1
19
85
5
51
65
0
23
10
1.23
98959126--98959222
3
31.7
3
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12
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60
6
2
30
1.32
98959154--98959226
25
2.8
26
83
8
94
60
8
0
31
1.26
98959141--98959218
31
2.6
29
80
15
86
64
7
0
28
1.21
98970366--98970459
28
3.2
27
66
30
68
28
25
17
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98970366--98970495
60
2.2
59
86
8
174
29
23
16
30
1.97
98971958--98972006
16
3.0
16
74
14
55
67
0
28
4
1.09
98974033--98974079
18
2.6
18
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21
53
55
0
2
42
1.12
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1.9
20
89
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60
33
0
0
66
0.92
98978339--98978377
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10
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60
33
0
0
66
0.92
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30
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2
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0
0
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0
0
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88
28
0
5
66
1.12
99000935--99000992
9
6.5
8
76
20
53
25
0
5
68
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325